Dies ist der Befehl bp_multi_hmmsearch.plp, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
multi_hmmsearch – führt eine hmmsearch in mehreren FASTA-Dateien durch mit
eine INDEX-Datei
ZUSAMMENFASSUNG
multi_hmmsearch -p hmm_file [-i] -f index_file
BESCHREIBUNG
Technisch gesehen kein Bio::Tools::Run-Skript, da dieses kein Bioperl oder Bioperl-run verwendet
Komponenten, aber es ist nützlich.
Verpflichtend Zubehör:
-p HMM-Profil, das für die Suche verwendet werden soll.
-f INDEX-Datei, die eine Liste der FASTA-Dateien für das Multiple enthält
Suche.
Spezial Zubehör:
-i Erstellt eine neue Indexdatei mit den resultierenden HMMS-Dateien. Das ist
nützlich, wenn Sie diese Liste als Eingabeargumente an übergeben möchten
andere Programme.
-h Diese Dokumentation anzeigen.
FEEDBACK
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Ihre Kommentare und Anregungen vorzugsweise an die Bioperl-Mailingliste. Deine Teilnahme
wird sehr geschätzt.
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Verwenden Sie bp_multi_hmmsearch.plp online über die Dienste von onworks.net
