Dies ist der Befehl bp_run_neighbor.plp, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
run_neighbor – führt Phylips „Nachbar“-Programm über Bioperl aus
ZUSAMMENFASSUNG
run_neighbor [-i Eingabedatei] [-o Ausgabedateiname]
BESCHREIBUNG
Stellen Sie eine Matrixdatei bereit, auf der Neighbor ausgeführt werden soll. Die Datei sollte nach dem Format file.matrix benannt werden
oder file.protdist (die Endung spielt keine Rolle, aber das Programm erwartet eine Datei in der Form
(\S+)\.(\S+).
Dadurch wird die Anwendung „neighbor“ ausgeführt, um aus einem Protein einen Neighbor-Joining-Baum zu erstellen
Distanzmatrix.
Verwenden Sie bp_run_neighbor.plp online über die Dienste von onworks.net
