Dies ist der Befehl fastaq-capillary_to_pairs, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
fastaq_capillary_to_pairs – Konvertiert eine Datei mit Kapillarlesevorgängen in gepaarte und ungepaarte Dateien
BESCHREIBUNG
Verwendung: fastaq_capillary_to_pairs
Erstellt anhand einer Datei mit Kapillarlesevorgängen eine verschachtelte Datei mit Lesepaaren (wobei mehr als
(Lesen aus derselben Ligation dauert am längsten) und eine Datei mit ungepaarten Lesevorgängen. Ersetzt
der .p1k/.q1k-Teil von Lesenamen zur Kennzeichnung von Vorwärts-/Rev-Lesevorgängen /1 und /2
positionell Argumente:
infile Name der Eingabe-Fasta/Q-Datei
outfiles-Präfix
Präfix der Ausgabedateien
optional Argumente:
-h, --help
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