Dies ist der Befehl fastq_quality_filter, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
fastq_quality_filter – Filtert Sequenzen basierend auf der Qualität
BESCHREIBUNG
Verwendung: fastq_quality_filter [-h] [-v] [-q N] [-p N] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] Teil von
FASTX Toolkit 0.0.14 von A. Gordon ([E-Mail geschützt] )
[-h] = Dieser hilfreiche Hilfebildschirm.
[-q N] = Mindestqualitätswert, der beibehalten werden muss.
[-p N] = Mindestprozentsatz der Basen, die die Qualität [-q] haben müssen.
[-z] = Ausgabe mit GZIP komprimieren.
[-i INFILE]
= FASTA/Q-Eingabedatei. Standard ist STDIN.
[-o OUTFILE] = FASTA/Q-Ausgabedatei. Der Standardwert ist STDOUT. [-v] = Ausführlich -
Anzahl der Sequenzen melden.
Wenn [-o] angegeben ist,
Bericht wird auf STDOUT gedruckt.
Wenn [-o] nicht angegeben ist (und die Ausgabe an STDOUT geht), wird der Bericht gedruckt an
STDERR.
Verwenden Sie fastq_quality_filter online über die Dienste von onworks.net
