Dies ist der Befehl fpromlke, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
fpromlk – Proteinphylogenie nach maximaler Wahrscheinlichkeit
ZUSAMMENFASSUNG
fpromlk -Reihenfolge seqsetall -intreefile Baum [-ncategories ganze Zahl] -Bewertung Array
-Kategorien immobilien [-Gewichte immobilien] -Längen boolean [-Modell Liste]
[-Gamma Liste] -Gammakoeffizient schweben -ngammacat ganze Zahl -Invarkoeffizient schweben
-ninvarcat ganze Zahl -invarfrac schweben -nhmmcategories ganze Zahl -hmmrates Array
-hmmwahrscheinlichkeiten Array -adjsite boolean -Lambda schweben -verwirren ganze Zahl
-Samen ganze Zahl -global boolean [-outgrno ganze Zahl] -outfile Outfile [-Forelle Umschalten]
-outtreefile Outfile [-Druckdaten boolean] [-Fortschritt boolean] [-Baumabdruck boolean]
[-hypstat boolean]
fpromlk -Hilfe
BESCHREIBUNG
fpromlk ist ein Kommandozeilenprogramm von EMBOSS („the European Molecular Biology Open
Software-Suite“). Es ist Teil der Befehlsgruppe(n) "Phylogenie:Molekulare Sequenz".
OPTIONAL
zufuhr Abschnitt
-Reihenfolge seqsetall
Datei mit einem oder mehreren Sequenz-Alignments
-intreefile Baum
-ncategories ganze Zahl
Standardwert: 1
-Bewertung Array
-Kategorien immobilien
-Gewichte immobilien
Zusätzliche Abschnitt
-Längen boolean
Standardwert: N
-Modell Liste
Standardwert: Jones-Taylor-Thornton
-Gamma Liste
Standardwert: n
-Gammakoeffizient schweben
Standardwert: 1
-ngammacat ganze Zahl
Standardwert: 1
-Invarkoeffizient schweben
Standardwert: 1
-ninvarcat ganze Zahl
Standardwert: 1
-invarfrac schweben
Standardwert: 0.0
-nhmmcategories ganze Zahl
Standardwert: 1
-hmmrates Array
Standardwert: 1.0
-hmmwahrscheinlichkeiten Array
Standardwert: 1.0
-adjsite boolean
Standardwert: N
-Lambda schweben
Standardwert: 1.0
-verwirren ganze Zahl
-Samen ganze Zahl
Standardwert: 1
-global boolean
Standardwert: N
-outgrno ganze Zahl
Output Abschnitt
-outfile Outfile
-Forelle Umschalten
Standardwert: Y
-outtreefile Outfile
-Druckdaten boolean
Standardwert: N
-Fortschritt boolean
Standardwert: Y
-Baumabdruck boolean
Standardwert: Y
-hypstat boolean
Standardwert: N
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