Dies ist der Befehl indigo-cano, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
indigo-cano – Erzeugen Sie kanonische SMILES oder geschichteten Code für Moleküle im MOL- oder SDF-Format
ZUSAMMENFASSUNG
Indigo-Cano Dateiname.{mol,rdf,rdf.gz,sdf,sdf.gz,smi} [Parameter]
Indigo-Cano - SMILES [Parameter]
BESCHREIBUNG
Indigo-Cano wird verwendet, um kanonische SMILES oder geschichteten Code für Moleküle in MOL oder zu erzeugen
SDF-Format.
OPTIONAL
Indigo-Cano erwartet eine Datei oder einen SMILES-Code auf der Standardeingabe, was dann der Fall sein könnte
gefolgt von einem oder mehreren der folgenden Parameter.
-smiles
Ausgabe kanonischer SMILES (Standard)
-geschichtet
Geben Sie kanonischen mehrschichtigen Code aus
-id
ID-Feld mit dem angegebenen Namen in einer SDF-Datei
-no-aroma
Aromatisieren Sie keine Moleküle
-kein Tetraeder
Ignorieren Sie tetraedrische Stereozentren
-no-cistrans
Informationen zu cis-trans-Anleihen ignorieren
Beispiele:
Indigo-Cano infile.sdf
Indigo-Cano infile.sdf.gz -id molregno > results.txt
Indigo-Cano infile.smi -geschichtet -no-cistrans
Indigo-Cano - 'NC1C=CC(O)=CC=1'
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