Dies ist der Befehl maf2anchors.pl, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
maf2anchors – Konvertiert MAF-Dateien in Murasaki-Ankersätze
ZUSAMMENFASSUNG
maf2anchors
OPTIONAL
--prefix=
als Präfix für Ausgabedateinamen verwenden (andernfalls verwendet )
--rifts=
bis hin zu Rissen zulassen.
--fakeseqs
Generieren Sie gefälschte Sequenzlängendateien und Sequenzstummel basierend auf Sequenzlängendaten
in der MAF-Datei
--Vertrauen
Vertrauen Sie der von TBA in der zweiten Zeile der Datei hinzugefügten Kommentaranmerkung (falls vorhanden).
dass es den im Alignment verwendeten Baum und alle beteiligten Sequenzen auflistet. Standardeinstellungen
weiter. Verwenden Sie --notrust, um TBA-Tags zu misstrauen (technisch gesehen sind diese Daten nicht Teil der
Dateiformatspezifikation und ist nur in Kommentare gepfercht, die TBA produziert, aber
ist möglicherweise nicht in allen MAF-Dateien vorhanden oder korrekt, daher bieten wir Ihnen die Möglichkeit dazu
misstraue ihm).
--Sortieren
Sortieren Sie die von --trust gefundenen Sequenzen (so dass sie mit der Ausgabe übereinstimmen, die hätte
passierte mit --notrust).
Nutzen Sie maf2anchors.pl online über die Dienste von onworks.net
