Dies ist der Befehl masai_output_pe, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
masai_output_pe - Masai-Ausgabe - Gepaarter Endmodus
ZUSAMMENFASSUNG
masai_output_pe [OPTIONEN]
BESCHREIBUNG
Masai ist ein schneller und genauer Read Mapper basierend auf ungefähren Seeds und multiplen
Rückverfolgung.
See http://www.seqan.de/projects/masai um mehr zu erfahren.
(c) Copyright 2011-2012 von Enrico Siragusa.
-h, --help
Zeigt diese Hilfemeldung an.
--Version
Zeigt Versionsinformationen
Pairing-Optionen:
-ng, --keine Lücken
Richten Sie Lesevorgänge nicht an Lücken aus.
-NS, --Bibliothekslänge NUM
Länge der Bibliothek. Standard: 220.
Le-, --Bibliotheksfehler NUM
Längentoleranz der Bibliothek. Standard: 50.
Ausgabeoptionen:
-t, --tmp-Ordner STR
Geben Sie einen riesigen temporären Ordner an. Standard: Verwenden Sie den Genom-Ordner.
-o, --Ausgabedatei FILE
Geben Sie eine Ausgabedatei an. Standard: Verwenden Sie das Reads-Dateinamenspräfix. Gültige Dateitypen
sind: roh und sam.
-nc, --Keine Zigarre
CIGAR-String nicht ausgeben. Dies betrifft nur die SAM-Ausgabe.
Debug-Optionen:
-nd, --no-dump
Ergebnisse nicht ausgeben.
VERSION
masai_output_pe Version: 0.7.1 [14053] Letztes Update 2013-05-16
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