mia-2dmyocard-ica – Online in der Cloud

PROGRAMM:

NAME/FUNKTION

mia-2dmyocard-ica – Führen Sie eine ICA-Analyse für eine Reihe von 2D-Bildern durch

ZUSAMMENFASSUNG

mia-2dmyocard-ica -i [Optionen]

BESCHREIBUNG

mia-2dmyocard-ica Dieses Programm wird verwendet, um eine ICA für eine Reihe von Myokardperfusionen durchzuführen
Bilder, um synthetische Referenzen zu erstellen, die zur bildbasierten Bewegungskorrektur verwendet werden können
Anmeldung. Wenn das Ziel darin besteht, eine vollständige Bewegungskompensation durchzuführen, ist es besser, sie zu erstellen
einen Segmentierungssatz und verwenden Sie mia-2dmyoica-nonrigid. Wenn die Eingabedaten mittels a angegeben werden
Segmentierungssatz, dann kann auch mia-2dmyocard-icaseries verwendet werden. Dieses Programm ist
Wird im Wesentlichen dazu verwendet, verschiedene Optionen für die Ausführung des ICA-Referenzimages zu testen
Schaffung.

OPTIONAL

-i --in-base=(Eingabe, erforderlich); io
Eingabedateiname des folgenden Musters nameXXXX.ext X=Zahlen Für unterstützte Datei
Typen siehe PLUGINS:2dimage/io

--coefs=
Mischkoeffizienten in diese Datei ausgeben

-o --out-base=(Ausgabe); Zeichenfolge
Basis des Ausgabedateinamens

-t --type=exr
Ausgabedateityp
Unterstützte Werte sind:( @, BMP, DCM, EXR, jpegs, JPG, PNG, ROH,
TIF, TIFF, V, AUSSICHT, bmp, DCM, exr, JPEG, jpg, png, roh, tif,
tiff, v, vista, )

-k --skip=2
Bilder am Anfang der Serie überspringenBilder am Anfang der Serie überspringen

-e --end=60
letztes Bild der Serieletztes Bild der Serie

-C --Komponenten=0
Nr. der Komponenten, 0=automatisch schätzennr. der Komponenten, 0=Schätzung
Im Prinzip so, wie Sie es von Google Maps kennen.

-m --strip-mean
Entfernen Sie das mittlere Bild aus der Serie

-f --save-features=
Feature-Bild speichern

-p --strip-periodic
Streifen nur periodische Komponente

-x --max-ica-iterations=0
maximale ICA-Löser-Iterationenmaximale ICA-Löser-Iterationen

-n --ica-normalisieren
ica_normalize-Funktionsbilder

--all-features=
Speichern Sie alle Feature-Bilder unter

-L --LV-crop-amp=0
LV-Crop-Maskenverstärkung, 0.0 = nicht beschneidenLV-Crop-Maskenverstärkung, 0.0
= nicht beschneiden

-a --auto-components
Automatische Schätzung der Anzahl der Komponenten basierend auf Korrelation. Impliziert
-m und -n (experimentell)

Hilfe & Info
-V --verbose=Warnung
Ausführlichkeit der Ausgabe, Ausgabe von Nachrichten mit gegebenem Level und höheren Prioritäten.
Unterstützte Prioritäten beginnend auf der niedrigsten Ebene sind:
Info - Low-Level-Meldungen
Spur - Funktionsaufruf-Trace
scheitern ‐ Testfehler melden
Warnung - Warnungen
Fehler - Fehler melden
debuggen - Debug-Ausgabe
Nachricht - Normale Nachrichten
tödlich - Nur schwerwiegende Fehler melden

--Urheberrechte ©
Copyright-Informationen drucken

-h - Hilfe
diese Hilfe ausdrucken

-? --Verwendungszweck
eine kurze Hilfe ausdrucken

--Version
Versionsnummer drucken und beenden

In Bearbeitung
--threads=-1
Maximale Anzahl von Threads, die für die Verarbeitung verwendet werden sollen. Diese Anzahl sollte niedriger sein
oder gleich der Anzahl der logischen Prozessorkerne in der Maschine. (-1:
automatische Schätzung). Maximale Anzahl von Threads, die für die Verarbeitung verwendet werden sollen
Anzahl sollte kleiner oder gleich der Anzahl der logischen Prozessorkerne sein
Die Maschine. (-1: automatische Schätzung).

PLUGINS: 2dbild/io

bmp Unterstützung für BMP 2D-Bildeingabe/-ausgabe

Erkannte Dateierweiterungen: .BMP, .bmp

Unterstützte Elementtypen:
Binärdaten, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit

Datenpool Virtuelle IO zum und vom internen Datenpool

Erkannte Dateierweiterungen: .@

Dicom 2D-Bild io für DICOM

Erkannte Dateierweiterungen: .DCM, .dcm

Unterstützte Elementtypen:
16 Bit mit Vorzeichen, 16 Bit ohne Vorzeichen

exr ein 2dimage io-Plugin für OpenEXR-Bilder

Erkannte Dateierweiterungen: .EXR, .exr

Unterstützte Elementtypen:
32 Bit ohne Vorzeichen, 32 Bit Fließkomma

jpg ein 2dimage io-Plugin für JPEG-Graustufenbilder

Erkannte Dateierweiterungen: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Unterstützte Elementtypen:
vorzeichenlose 8-Bit

png ein 2dimage io-Plugin für PNG-Bilder

Erkannte Dateierweiterungen: .PNG, .png

Unterstützte Elementtypen:
Binärdaten, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit

roh Unterstützung für RAW 2D-Bildausgabe

Erkannte Dateierweiterungen: .RAW, .raw

Unterstützte Elementtypen:
Binärdaten, Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 16 Bit, Vorzeichen 16 Bit,
32 Bit mit Vorzeichen, 32 Bit ohne Vorzeichen, 32 Bit Fließkomma, 64 Bit Fließkomma
Bit

tif Unterstützung für TIFF 2D-Bildeingabe/-ausgabe

Erkannte Dateierweiterungen: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Unterstützte Elementtypen:
Binärdaten, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit, unsigned 32 bit

Aussicht ein 2dimage io-Plugin für Vista-Bilder

Erkannte Dateierweiterungen: .V, .VISTA, .v, .vista

Unterstützte Elementtypen:
Binärdaten, Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 16 Bit, Vorzeichen 16 Bit,
32 Bit mit Vorzeichen, 32 Bit ohne Vorzeichen, 32 Bit Fließkomma, 64 Bit Fließkomma
Bit

BEISPIEL

Werten Sie die synthetischen Referenzen der Bilder imageXXXX.exr aus und speichern Sie sie in refXXXX.exr
Durch die Verwendung von fünf unabhängigen Komponenten werden zwei Bilder entfernt, normalisiert und übersprungen.

mia-2dmyocard-ica -i imageXXXX.exr -o ref -k 2 -C 5 -m -n

AUTOR(n)

Gert Wollny

COPYRIGHT

Diese Software ist urheberrechtlich geschützt (c) 1999-2015 Leipzig, Deutschland und Madrid, Spanien. Es kommt
mit ABSOLUT KEINE GEWÄHRLEISTUNG und Sie dürfen es unter den Bedingungen der GNU . weitergeben
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Option '--Urheberrecht'.

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