Dies ist der Befehl TransDecoder.LongOrfs, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
Transdecoder.LongOrfs – Transkriptom-Proteinvorhersage
ANWENDUNG
Erforderlich:
-T Transkripte.fasta
Optional:
-M Mindestproteinlänge (Standard: 100)
-G genetischer Code (Standard: universal; siehe PerlDoc; Optionen: Euplotes, Tetrahymena, Candida, Acetabularia)
-S-Strang-spezifisch (analysiert nur den oberen Strang)
Genetisch Codes
Sehenhttp://golgi.harvard.edu/biolinks/gencode.html>. Diese werden derzeit unterstützt:
universell (Standard)
Euploten
Tetrahymena
Candida
Acetabularien
Mitochondrial-kanonisch
Mitochondriale Wirbeltiere
Mitochondrien-Arthropoden
Mitochondrien-Stachelhäuter
Mitochondrien-Mollusken
Mitochondriale Ascidianer
Mitochondriale Nematoden
Mitochondrien-Platyhelminthen
Mitochondriale Hefen
Mitochondriale Euascomyceten
Mitochondriale Protozoen
2015-12-28 TRANSDECODER.LONGORFS(1)
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