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TransDecoder.LongOrfs – Online in der Cloud

Führen Sie TransDecoder.LongOrfs im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks über Ubuntu Online, Fedora Online, den Windows-Online-Emulator oder den MAC OS-Online-Emulator aus

Dies ist der Befehl TransDecoder.LongOrfs, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann

PROGRAMM:

NAME/FUNKTION


Transdecoder.LongOrfs – Transkriptom-Proteinvorhersage

ANWENDUNG


Erforderlich:

-T Transkripte.fasta

Optional:

-M Mindestproteinlänge (Standard: 100)

-G genetischer Code (Standard: universal; siehe PerlDoc; Optionen: Euplotes, Tetrahymena, Candida, Acetabularia)

-S-Strang-spezifisch (analysiert nur den oberen Strang)

Genetisch Codes


Sehenhttp://golgi.harvard.edu/biolinks/gencode.html>. Diese werden derzeit unterstützt:

universell (Standard)
Euploten
Tetrahymena
Candida
Acetabularien
Mitochondrial-kanonisch
Mitochondriale Wirbeltiere
Mitochondrien-Arthropoden
Mitochondrien-Stachelhäuter
Mitochondrien-Mollusken
Mitochondriale Ascidianer
Mitochondriale Nematoden
Mitochondrien-Platyhelminthen
Mitochondriale Hefen
Mitochondriale Euascomyceten
Mitochondriale Protozoen

2015-12-28 TRANSDECODER.LONGORFS(1)

Verwenden Sie TransDecoder.LongOrfs online über die Dienste von onworks.net


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