Dies ist die Linux-App namens DACO-algorithm, die unter Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als JDACO_1.03.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens DACO-algorithm herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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DACO-Algorithmus zur Ausführung unter Linux online
BESCHREIBUNG
Die eukaryotische Genexpression wird durch molekulare Logikschaltkreise gesteuert, die regulatorische Signale vieler verschiedener Faktoren kombinieren. Die Komplexierung von Transkriptionsfaktoren und anderen regulatorischen Proteinen ist ein vorherrschender und hochkonservierter Mechanismus der Signalintegration innerhalb kritischer regulatorischer Wege und ermöglicht den Rückschluss auf kontrollierte Gene sowie auf den ausgeübten regulatorischen Mechanismus.Wir haben DACO (Domain-Aware Cohesiveness Optimization) entwickelt, einen neuartigen Algorithmus, der Protein-Protein-Interaktionsnetzwerke und Domänen-Domänen-Interaktionsnetzwerke mit der metrischen Kohäsivität in Clusterqualität kombiniert. Die Metrik wird auf der ganzheitlichen Ebene der Proteininteraktionen lokal maximiert, während ausgeklügelte Konnektivitätsbeschränkungen auf Domänenebene verwendet werden, um die exklusive und somit inhärent kombinatorische Natur der Wechselwirkungen innerhalb solcher Anordnungen zu berücksichtigen.
Die Originalpublikation finden Sie auf http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/30/17/i415 .
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Konsole/Terminal
Programmiersprache
Python, Java
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/dacoalgorithm/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.