Dies ist die Linux-App namens datasw, die unter Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als datasw-mac.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens datasw herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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datasw zur Ausführung unter Linux online
BESCHREIBUNG
Die Kleinwinkel-Röntgenstreuung (SAXS) in Lösung ist eine gängige Methode mit niedriger Auflösung, die hochauflösende Informationen, die durch Kristallographie oder NMR gewonnen werden, effizient ergänzen kann. Die Probenmonodispersität ist der Schlüssel zur zuverlässigen SAXS-Dateninterpretation und Modellbildung. Strahllinienaufbauten mit Inline-Hochleistungsflüssigkeitschromatographie (HPLC) sind besonders nützlich für die genaue Profilierung heterogener Proben. Das Programm DATASW führt die Mittelung einzelner Datenrahmen aus dem HPLC-SAXS-Experiment mithilfe eines Schiebefensters mit einer vom Benutzer angegebenen Größe durch, berechnet Gesamtparameter (I(0), Rg, Dmax und MW) und sagt den Faltzustand (gefaltet/entfaltet) voraus. der Probe. Anwendungen von DATASW werden für mehrere Proteine mit unterschiedlichem Oligomerisierungsverhalten veranschaulicht, das an verschiedenen Strahllinien aufgezeichnet wurde.Wenn Sie DATASW in Ihrer Arbeit verwenden, geben Sie bitte Folgendes an:
Shkumatov AV & Strelkov SV (2015) Acta Cryst. D71, 1347–1350
Eigenschaften
- Puffersubtraktion
- Bildmittelung mithilfe eines Schiebefensters mit benutzerdefinierter Größe
- Berechnung von Rg, I0, Dmax entweder mittels Guinier-Näherung oder indirekter Fourier-Transformation
- Schätzung des Molekulargewichts anhand des Porod-Volumens, des Korrelationsvolumens und des SAXS-MoW
- Spitzenerkennung
- Zeichnen Sie Ergebnisse interaktiv mit den Grenzen verschiedener Achsen auf
- Dimensionsloses Kratky-Diagramm für die Probe und zwei Referenzproteine (BSA und ungefaltetes hTau40wt).
- interaktive Mittelung von Datenrahmen und Normalisierung des dimensionslosen Kratky-Diagramms
Publikum
Wissenschaft/Forschung, Bildung
Benutzeroberfläche
Befehlszeile
Programmiersprache
Perl
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/datasw/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
