Dies ist die Linux-App Just_Preprocess_My_Reads, deren neueste Version als justpreprocessmyreads_Aug2015c.tar.gz heruntergeladen werden kann. Sie kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens Just_Preprocess_My_Reads kostenlos herunter und führen Sie sie online mit OnWorks aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
Meine Lesevorgänge einfach vorverarbeiten
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BESCHREIBUNG
Identifiziert rRNA, Kontaminanten, Schnitte auf herkömmliche Weise usw. Behält Lesepaare bei. Entwickelt für Fire-and-Forget-Projekte mit hohem Durchsatz (Terabyte an Daten).
Verwendet pbzip2, bowtie2, fastx_toolkit, samtools, fastqc, Trimmomatic (optional)
Eigenschaften
- Illumina-Vorverarbeitung
- Kontaminationskontrolle
Publikum
Wissenschaftsforschung
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/justpreprocessmyreads/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
