Dies ist die Linux-App namens metasort, die unter Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als metaSort.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens metasort herunter und führen Sie sie online aus, um sie online mit OnWorks kostenlos unter Linux auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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metasort für die Online-Ausführung unter Linux
BESCHREIBUNG
Die meisten aktuellen Ansätze analysieren metagenomische Daten unter Beteiligung von Referenzgenomen. Neue mikrobielle Gemeinschaften gehen jedoch weit über die Abdeckung von Referenzdatenbanken hinaus, und die De-novo-Metagenom-Zusammensetzung aus komplexen mikrobiellen Gemeinschaften bleibt immer noch eine große Herausforderung. Hier präsentieren wir ein neues experimentelles und bioinformatisches Framework, metaSort, für die effektive Konstruktion bakterieller Genome aus metagenomischen Proben. MetaSort bietet einen sortierten Mini-Metagenom-Ansatz, der auf Durchflusszytometrie- und Einzelzell-Sequenzierungsmethoden basiert, und verwendet neue Rechenalgorithmen, um qualitativ hochwertige Genome aus dem sortierten Mini-Metagenom durch Komplementärbildung zum ursprünglichen Metagenom effizient wiederzugewinnen. Durch umfangreiche Auswertungen von simulierten Datensätzen, Speichel- und Darmmikrobiomen haben wir gezeigt, dass metaSort eine hervorragende und unvoreingenommene Leistung bei der Genomwiederherstellung und -assemblierung aufweist.Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/metasort/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
