Dies ist die Linux-App namens PolyCTLDesigner, deren neueste Version als dist_PolyCTLDesigner.0.3.a.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens PolyCTLDesigner mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
PolyCTLDesigner
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BESCHREIBUNG
Anhand der Peptide (T-Zell-Epitope) wählt PolyCTLDesigner flankierende Sequenzen aus, um die TAP-Bindung zu optimieren, und verbindet die resultierenden Oligopeptide so zu einem Polyepitop, dass eine effiziente Freisetzung potenzieller Epitope durch proteasomale und/oder immunproteasomale Verarbeitung gewährleistet und die Anzahl der Verbindungsepitope minimiert wird. Für die Konstruktion von Polyepitopen nutzt PolyCTLDesigner bekannte Aminosäuremuster der Proteasom-Spaltung und TAP-Bindungsspezifität. PolyCTLDesigner ist auch in der Lage, antigenische Peptide auszuwählen, die ein ausgewähltes HLA-Repertoire mit der gewünschten Redundanzrate abdecken. Aufgrund der Antigensequenzen ist PolyCTLDesigner auch in der Lage, T-Helfer-Epitope auszuwählen. Zur Vorhersage von T-Zell-Epitopen wird TEpredict verwendet.
Publikum
Wissenschaftsforschung
Programmiersprache
Python
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/polyctldesigner/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
