Dies ist die Linux-App namens RUbioSeq, die unter Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als RUbioSeq3.8.1.tgz heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens RUbioSeq herunter und führen Sie sie online aus, um sie online mit OnWorks kostenlos unter Linux auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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RUbioSeq läuft unter Linux online
BESCHREIBUNG
Die steigende Nachfrage nach Next-Generation-Sequencing (NGS)-Studien hat die Notwendigkeit integrierter und zuverlässiger Pipelines zur effizienten Analyse von Deep-Sequencing-Experimenten deutlich gemacht. Wir präsentieren RUbioSeq+, eine eigenständige und plattformübergreifende Anwendung zur integrierten Analyse von NGS-Daten. Genauer gesagt implementiert unsere Software Pipelines für die Analyse von Einzelnukleotid- und Kopienzahlvariationen, Bisulfit-Seq- und ChIP-Seq-Experimenten unter Verwendung etablierter Tools, um diese üblichen Aufgaben auszuführen. RUbioSeq+ ist kostenlos und enthält alle Kernfunktionen, die in der ursprünglichen Version von RUbioSeq (v3.2.1) implementiert wurden, übertrifft und erweitert jedoch auch die Fähigkeiten von RUbioSeq, die die parallelisierte Analyse vollständiger Genome in Computerfarmen unterstützen. RUbioSeq+ enthält auch eine neue Benutzeroberfläche, die für interdisziplinäre Forschungsgruppen entwickelt wurde, in denen Bioinformatiker und biomedizinische Forscher zusammenarbeiten.Programmiersprache
Perl
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/rubioseq/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
