Dies ist die Windows-App namens Genome Microsatellite Analyzing Tool, deren neueste Version als gmatoV1.2Build20130106.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens Genome Microsatellite Analyzing Tool mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS
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Genom-Mikrosatelliten-Analysetool
BESCHREIBUNG
Die zunehmende Verfügbarkeit von Sequenzen immer größerer Gesamtgenome (>1G) machte die derzeit vorhandenen SSR-Analysetools zunichte. Das Genome-Wide Microsatellite Analyzing Tool (GMATo) ist ein neuartiges, leistungsstarkes Programm für schnelleres SSR-Mining in jeder Länge und Größe sowie eine umfassende statistische Analyse unter Genomaspekten, das speziell für große Genome auf der Grundlage von Perl-Skripten entwickelt wurde. Es ist nur eine Eingabedatei erforderlich, die DNA-Sequenzen im rohen Fasta-Format enthält, und Ausgabedateien im Tabellenformat enthalten alle SSR-Loci-Informationen und die statistische Verteilung in vier für Biologen interessierten Klassifikationen. GMATo verfügt außerdem über eine einfache und grafische Benutzeroberfläche mit Skripten in Java und eine Befehlszeilenschnittstelle in Perl, die entweder auf Windows-, Linux- und Mac-Plattformen usw. ausgeführt werden kann und eine einfach anpassbare Parametersteuerung für Biologen und Bioinformatiker bietet. Die Software GMATo ist ein besseres Werkzeug zur SSR-Charakterisierung in einem riesigen Genomzitieren Sie dieses Papier: Wang X. et al, Bioinformation [2013, 9(10):541-544]
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/gmato/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
