Dies ist die Windows-App namens JSiteDescriptor, die unter Windows online über Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als binaries.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens JSiteDescriptor herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Windows online über Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
JSiteDescriptor zur Ausführung unter Windows online über Linux online
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BESCHREIBUNG
Eine Reihe von Java-Programmen, die Koordinaten- und chemische Informationen aus PDB-Dateien extrahieren.Die Bindungsstellenbereiche werden mithilfe eines gitterbasierten Schemas extrahiert.
Für die Bindungsstelle wird ein räumlich-chemischer Deskriptor basierend auf dem PocketMatch-Algorithmus von Dr. Kalidas (ebenfalls Autor dieses Projekts) generiert.
Eigenschaften
- Generierung eines PocketMatch-basierten Vektordeskriptors für eine Bindungsstelle
- Läuft im Einzel-PDB-Dateimodus oder im Batch-Modus
- Angabe der Stelle als Ligandennachbarschaft – (Ligandcode, Name und Ketten-ID)
- Angabe der Site als PDB-Subset-Nachbarschaft mithilfe von REGULAR EXPRESSIONS
- Spezifikation mehrerer Atombereiche, die eine Bindungsstelle auskleiden
- Die Verarbeitungsdatei im Stapelmodus erfasst Eingabeparameter über eine XML-Datei und entspricht der XSD-Spezifikation
- Größere Konfigurierbarkeit – Auswahl der Restgruppen, Radius und Kategorien für Standorte
- Java Swing-Technologie für GUI
- Einfache und erweiterbare Softwarearchitektur für zukünftige Entwicklungen
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Java-Schaukel
Programmiersprache
Javac
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/jsitedescriptor/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
