Dies ist die Windows-App namens „Microarray Associated Pattern Analysis“, die unter Windows über Linux ausgeführt werden kann und deren neueste Version als MAMA_latest.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App mit dem Namen „Microarray Associated Motiv Analyzer“ herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Windows online über Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
Microarray-assoziierter Motivanalysator zur Ausführung unter Windows online über Linux online
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BESCHREIBUNG
Wir haben eine neuartige Clustering-freie Methode entwickelt, den Microarray-assoziierten Motivanalysator (MAMA), um neue cis-wirkende Elemente basierend auf gewichteten Sequenzähnlichkeiten und Genexpressionsprofilen in Microarray-Analysen vorherzusagen. Die Simulation der Genexpression wurde mithilfe einer Support-Vektor-Maschine und basierend auf dem Vorhandensein vorhergesagter Motive und Motivpaare durchgeführt. Die Genauigkeit der simulierten Genexpression wurde verwendet, um die Qualität der Vorhersage zu bewerten und die in dieser Methode verwendeten Parameter zu optimieren. Nach der Optimierung simulierte MAMA mehr als 87 % der Genexpression genau.Siehe Kakei Y, Ogo Y, Itai RN, et al. (2013) Entwicklung einer neuartigen Vorhersagemethode für cis-Elemente zur Hypothese kollaborativer Funktionen von cis-Elementpaaren bei Eisenmangel. Reis 6(1): 22.
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Befehlszeile
Programmiersprache
Python, Perl, C
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/microarray-motif-analyzer/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
