Dies ist die Windows-App namens PBSuite, deren neueste Version als PBSuite_15.8.24.tgz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens PBSuite mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS
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PBSuite
BESCHREIBUNG
Dies beherbergt derzeit zwei Projekte, die von Adam English erstellt und verwaltet werden.
PBJelly - das Genom-Upgrade-Tool.
PBHoney - das Tool zur Entdeckung struktureller Variationen
Beide sind im PBSuite-Code enthalten, der in Downloads zu finden ist.
----- PBGelee -----
Lies das Dokument
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0047768
PBJelly ist eine hochautomatisierte Pipeline, die lange Sequenzierungs-Reads (wie PacBio RS-Reads oder lange 454-Reads im Fasta-Format) auf hochgradig zuverlässige Draft-Assemblys ausrichtet. PBJelly füllt oder reduziert so viele eingefangene Lücken wie möglich, um verbesserte Entwurfsgenome zu produzieren.
----- PBHonig -----
Lies das Dokument
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/180/abstract
PBHoney ist eine Implementierung von zwei Variantenidentifikationsansätzen, die entwickelt wurden, um die hohe Abbildungsfähigkeit von langen Lesevorgängen (dh mehr als 10,000 bp) auszunutzen. PBHoney berücksichtigt sowohl Intra-Read-Diskordanz als auch weich abgeschnittene Tails von langen Reads, um strukturelle Varianten zu identifizieren.
Eigenschaften
- Genom-Assembly
- Genom-Upgrade
- Strukturelle Variation
- Montagebewertung
Publikum
Wissenschaftsforschung
Programmiersprache
Python
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/pb-jelly/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
