Este es el comando aevol_propagate que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
aevol: una plataforma de evolución experimental in silico
SINOPSIS
aevol_propagar -h or --ayuda
aevol_propagar -V or --versión
aevol_propagar [-v] [-g ENERO] [-i ÍNDICE] [-o EXTERIOR] [-S SEMILLA GENERAL]
aevol_propagar [-v] [-g ENERO] [-i ÍNDICE] [-o EXTERIOR] [-s SEMILLAS SELECCIONADAS] [-m MUTSEED] [-t
SEMILLA BOCADA] [-e ENVARSEED] [-n EMOCIONADO]
DESCRIPCIÓN
aevol es una plataforma de simulación que permite dejar que poblaciones de organismos digitales
evolucionar en diferentes condiciones y estudiar experimentalmente los mecanismos responsables de la
estructuración del genoma y del transcriptoma.
aevol_propagar
crea una copia nueva del experimento tal como estaba en la generación dada. los
el número de generación de la copia se restablecerá a 0. Si usa aevol_propagate
repetidamente para inicializar varias simulaciones, debe especificar una semilla diferente
para cada simulación; de lo contrario, todas las simulaciones producirán exactamente los mismos resultados.
Puede utilizar la opción -S para hacerlo. En este caso, los dibujos aleatorios serán
diferente para todos los procesos aleatorios habilitados en sus simulaciones (mutaciones,
expresión génica estocástica, selección, migración, variación ambiental,
ruido ambiental). Alternativamente, para cambiar los dibujos aleatorios por específicos
procesos aleatorios solamente, no use -S sino las opciones -m, -s, -t, -e, -n (ver
abajo).
OPCIONES
-h, --ayuda
imprimir ayuda, luego salir
-V, --versión
imprimir el número de versión, luego salir
-v, --verboso
ser detallado
-gramo, --genero ENERO
especificar el número de generación (predeterminado: el contenido en el archivo last_gener.txt, si lo hubiera)
-I, --en ÍNDICE
especificar directorio de entrada (predeterminado ".")
-Oh, --fuera EXTERIOR
especificar directorio de salida (predeterminado "./output")
-S, - semilla general SEMILLA GENERAL
especifique un número entero que se utilizará como semilla para números aleatorios. Si utiliza
aevol_propagate repetidamente para inicializar varias simulaciones, debe especificar un
semilla diferente para cada simulación; de lo contrario, todas las simulaciones producirán
exactamente los mismos resultados. Si especifica esta semilla general, se realizarán dibujos aleatorios.
diferente para todos los procesos aleatorios habilitados en sus simulaciones (mutaciones,
expresión génica estocástica, selección, migración, variación ambiental,
ruido ambiental). Para cambiar los dibujos aleatorios por un proceso aleatorio específico
solo, no use -S sino las opciones siguientes.
-s, --sel-semilla SEMILLAS SELECCIONADAS
especificar un número entero como semilla para los números aleatorios necesarios para la selección y migración
(si la estructura espacial está habilitada).
-metro, --mut-semilla MUTSEED
especifique un número entero como semilla para los números aleatorios necesarios para las mutaciones.
-t, --stoch-semilla SEMILLA BOCADA
especificar un número entero como semilla para los números aleatorios necesarios para el gen estocástico
expresión.
-mi, --env-var-semilla ENVARSEED
especifique un número entero como semilla para los números aleatorios necesarios para la variación ambiental.
-norte, --env-ruido-semilla EMOCIONADO
especifique un número entero como semilla para los números aleatorios necesarios para el ruido ambiental.
Utilice aevol_propagate en línea utilizando los servicios de onworks.net
