Este es el comando altree-convertp que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
altree-convert - Título ...
SINOPSIS
altree-convert [opciones]
Opciones:
--versión del programa de versión
--short-help | h mensaje de ayuda breve
- mensaje de ayuda de ayuda con descripciones de opciones
--man documentación completa
--first-input-file | i archivo de entrada 1
--second-input-file | j archivo de entrada 2 (no obligatorio)
--output-file | o archivo de salida
--case-control-output | salida c que contiene los nb casos / controles
- tipo de datos | t DNA | NUM
--phylo-prog | p PAUP | PHYLIP
--reconstruct-prog | r FASE | FAMHAP
--data-quali | q Tipo de datos: cualitativos o cuantitativos
--nbind -reshold | s Número mínimo de individuos necesarios para mantener un haplotipo
CAMPUS
--versión
Imprime la versión del programa y sale.
- ayuda corta
Imprime un breve mensaje de ayuda y sale.
--ayuda Imprima un mensaje de ayuda con descripciones de opciones y salidas.
--hombre Imprime la página del manual y sale.
--primer-archivo-de-entrada | i
Archivo de entrada 1 (salida del programa de reconstrucción de haplotipos)
--segundo-archivo-de-entrada | j
Archivo de entrada 2 (segunda salida de la familia o archivo que contiene el estado de la enfermedad)
--archivo-de-salida | o
Archivo de salida
--case-control-output | c
Archivo de salida que contiene el número de casos y controles que llevan cada haplotipo
- tipo de datos | t "ADN" | "SNP"
Tipo de datos: ADN (ATGCU) o SNP (0-1)
--phylo-prog | p "phylip" | "paup"
Programa de reconstrucción de filogenia
reconstruir-prog | r "famhap | fase"
Programa de reconstrucción de haplotipos
calidad-datos | q "cualitativo | cuantitativo"
Tipo de datos analizados
nbind-umbral | s
Se requiere un número mínimo de individuos portadores de un haplotipo para conservarlo durante
análisis mas extenso. Si desea mantener todos los haplotipos, debe afectar 0 a este
variable
DESCRIPCIÓN
Este programa leerá los archivos de entrada dados y generará un archivo de entrada para el
software de reconstrucción filogenética paup o phylip / paml
Use altree-convertp en línea usando los servicios de onworks.net
