Este es el comando bp_multi_hmmsearch.plp que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
multi_hmmsearch: realice una búsqueda hmm en varios archivos FASTA utilizando
un archivo INDEX
SINOPSIS
multi_hmmsearch -p archivo_hmm [-i] -f archivo_índice
DESCRIPCIÓN
Técnicamente no es un script de Bio :: Tools :: Run, ya que no utiliza Bioperl o Bioperl-run
componentes pero es útil.
Obligatorio Opciones:
-p Perfil HMM que se utilizará para la búsqueda.
-f archivo INDEX que contiene una lista de archivos FASTA para los múltiples
buscar.
Especiales Opciones:
-i Crea un nuevo archivo de índice con los archivos hmms resultantes. Este es
útil si desea pasar esta lista como argumentos de entrada a
otros programas.
-h Muestra esta documentación.
REALIMENTACIÓN
Correo Listas
Los comentarios de los usuarios son una parte integral de la evolución de este y otros módulos de Bioperl. Enviar
sus comentarios y sugerencias preferiblemente a la lista de correo de Bioperl. Tu participación
es muy apreciado
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Informes Errores
Informe los errores al sistema de seguimiento de errores de Bioperl para ayudarnos a realizar un seguimiento de los errores y sus
resolución. Los informes de errores se pueden enviar a través de la web:
http://redmine.open-bio.org/projects/bioperl/
Utilice bp_multi_hmmsearch.plp en línea utilizando los servicios de onworks.net
