Este es el comando bp_nrdbp que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
bp_nrdb.PLS: un script para emular el nrdb de Warren Gish, crea una base de datos de secuencia única a partir de
un conjunto de bases de datos de entrada
SINOPSIS
Uso:
bp_nrdb.PLS [opciones] archivo1 archivo2 archivo3
Uso alternativo
bp_nrdb.PLS -p [opciones] archivo1 id1 archivo2 id2 archivo3 id3
DESCRIPCIÓN
Este script creará una base de datos única de secuencias (cuasi no redundante). Las opciones
son:
-o nombre de archivo: el nombre de archivo en el que se escribe la base de datos (STDOUT de forma predeterminada)
-a nombre de archivo: el nombre de archivo al que agregar la base de datos
-l # - longitud mínima de secuencia requerida
-i - no buscar duplicados
-n # - número máximo de descripciones para informar por seq.
-d # - delimitador para usar entre descripciones consecutivas
-p: usa los prefijos de identificación de la base de datos desde la línea de comando
Use bp_nrdbp en línea usando los servicios de onworks.net
