Este es el comando cmtk-asegment_sri24 que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
asegment_sri24 - Segmentación usando el atlas SRI24
SINOPSIS
segmento_sri24 Imagen de destino Imagen de salida
DESCRIPCIÓN
Registre una imagen de destino en un canal seleccionado del atlas del cerebro humano SRI24, luego
formatee uno de los mapas de etiquetas del atlas en la imagen de destino. Nota: se supone que el
La imagen de destino está despojada del cráneo, es decir, contiene solo el cerebro.
OPCIONES
Alcance Herramientas (estas están compartido by que todas CMTK herramientas)
--ayuda
Escriba la lista de opciones básicas de la línea de comandos en la salida estándar.
--ayudar a todo
Escriba una lista completa de opciones de línea de comandos básicas y avanzadas en la salida estándar.
--wiki
Escriba la lista de opciones de la línea de comandos en la salida estándar en el marcado de MediaWiki.
--hombre
Escriba el código fuente de la página man con el marcado 'nroff' en la salida estándar.
--xml
Escriba la especificación de la sintaxis de la línea de comandos en el marcado XML (para la integración de Slicer).
--versión
Escriba la versión del kit de herramientas en la salida estándar.
--eco
Escribe la línea de comando actual en la salida estándar.
- nivel de verbo
Establecer el nivel de verbosidad.
--verboso, -v
Incrementar el nivel de verbosidad en 1 (obsoleto; admitido por compatibilidad con versiones anteriores).
--hilos
Establezca el número máximo de subprocesos paralelos (para subprocesos POSIX y OpenMP).
Main
--rápido, -f
Modo rápido.
--canal de registro
El canal SRI24 utilizado para el registro de la imagen de destino. Valores admitidos:
"spgr", "early-fse", "late-fse", "fa", donde el valor predeterminado es "spgr", o utilice uno de los
siguientes:
--spgr
Canal estructural SPGR (ponderado en T1) [Esta is la defecto]
- temprano-fse
Canal de eco de espín rápido de eco temprano (ponderado en PD)
--late-fse
Canal de eco de espín rápido de eco tardío (ponderado en T2)
--fa Canal de anisotropía fraccional, derivado de imágenes del tensor de difusión
--etiqueta-mapa
El mapa de etiquetas SRI24 que se reformatea a la imagen de destino. Valores admitidos:
"tzo116plus", "lpba40", "tissue", donde el valor predeterminado es "tzo116plus", o utilice uno de los
el seguimiento:
--tzo116plus
Plantilla de parcelación cortical extendida basada en la región AAL 116 de Tzourio-Mazoyer
plantilla. [Esta is la defecto]
--lpba40
Plantilla basada en la segmentación LONI Probabilistic Brain Atlas de 40 sujetos.
--tejido
Segmentación de tejido de máxima probabilidad de tres compartimentos (GM, WM, CSF) de SRI24
mapa.
AUTORES
Torsten Rohlfing, con contribuciones de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff y Yaroslav Halchenko
Use cmtk-asegment_sri24 en línea usando los servicios de onworks.net
