Este es el comando cmtk-interleaved_bad_slices que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
interleaved_bad_slices: busque cortes defectuosos en una serie de tiempo de imágenes intercaladas (p. ej., una
serie de resonancia magnética funcional en estado de reposo).
SINOPSIS
Interleaved_bad_slices Rutas de imágenes
DESCRIPCIÓN
Esta herramienta lee una serie temporal de imágenes en 3D y detecta valores atípicos.
CAMPUS
Buscar Kit de herramientas Opciones (estas en compartido by todos CMTK herramientas)
--ayuda
Escriba la lista de opciones básicas de la línea de comandos en la salida estándar.
--ayudar a todo
Escriba una lista completa de opciones de línea de comandos básicas y avanzadas en la salida estándar.
--wiki
Escriba la lista de opciones de la línea de comandos en la salida estándar en el marcado de MediaWiki.
--hombre
Escriba el código fuente de la página man con el marcado 'nroff' en la salida estándar.
--versión
Escriba la versión del kit de herramientas en la salida estándar.
--eco
Escribe la línea de comando actual en la salida estándar.
- nivel de verbo
Establecer el nivel de verbosidad.
--verboso, -v
Incrementar el nivel de verbosidad en 1 (obsoleto; admitido por compatibilidad con versiones anteriores).
--hilos
Establezca el número máximo de subprocesos paralelos (para subprocesos POSIX y OpenMP).
Entrada Opciones
--orientación de las rebanadas
Defina la orientación del corte de las imágenes de difusión. Valores admitidos: "axial",
"sagital", "coronal", "corte-x", "corte-y", "corte-z", donde el valor predeterminado es "axial",
o utilice uno de los siguientes:
--axial
Cortes axiales [Esta is las defecto]
--sagital
Cortes sagitales
--coronal
Cortes coronales
- rebanada-x
El eje de coordenadas X es la dirección de corte
- rebanada-y
El eje de coordenadas Y es la dirección del corte
- rebanada-z
El eje de coordenadas Z es la dirección de corte [Esta is las defecto]
Malo Rebanada Detección
--métrico
Métrica de similitud de imagen a imagen para comparar sectores vecinos. Valores admitidos:
"ncc", "rms", donde el valor predeterminado es "ncc", o utilice uno de los siguientes:
--ICONA
Correlación cruzada normalizada. [Esta is las defecto]
--rms
Raíz de diferencias cuadráticas medias.
--stdev-umbral
Umbral para la identificación de cortes defectuosos en unidades de desviaciones estándar de intensidad sobre
todos los cortes correspondientes de las imágenes de difusión restantes. [Defecto: 3]
Salida Opciones
- mal-rebanadas-trillar
Número mínimo de cortes defectuosos detectados antes de informar un volumen (solo el número de
En este caso, se informa de los cortes defectuosos detectados, en lugar de cada corte por separado).
[Defecto: 0]
AUTORES
Torsten Rohlfing, con contribuciones de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff y Yaroslav Halchenko
Use cmtk-interleaved_bad_slices en línea usando los servicios de onworks.net
