Este es el comando fastq_quality_filter que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
fastq_quality_filter: filtra secuencias según la calidad
DESCRIPCIÓN
uso: fastq_quality_filter [-h] [-v] [-q N] [-p N] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] Parte de
Kit de herramientas FASTX 0.0.14 por A. Gordon ([email protected])
[-h] = Esta útil pantalla de ayuda.
[-q N] = Puntuación de calidad mínima que se debe mantener.
[-p N] = Porcentaje mínimo de bases que deben tener calidad [-q].
[-z] = Comprimir la salida con GZIP.
[-i ARCHIVO]
= Archivo de entrada FASTA / Q. el predeterminado es STDIN.
[-o OUTFILE] = Archivo de salida FASTA / Q. el predeterminado es STDOUT. [-v] = Detallado -
informe del número de secuencias.
Si se especifica [-o],
el informe se imprimirá en STDOUT.
Si no se especifica [-o] (y la salida va a STDOUT), el informe se imprimirá en
ESTDERR.
Utilice fastq_quality_filter en línea utilizando los servicios de onworks.net
