Este es el comando gdcm2vtk que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
gdcm2vtk: convierte un archivo compatible con VTK en DICOM.
SINOPSIS
gdcm2vtk [opciones] entrada de archivo salida de archivo
DESCRIPCIÓN
El gdcm2vtk toma como entrada cualquier archivo compatible con VTK (incluido el archivo DICOM) y
generar como salida un archivo DICOM.
PARÁMETROS
nombre de archivo de entrada de archivo (compatible con DICOM o VTK)
nombre de archivo de salida de salida de archivo (compatible con DICOM o VTK)
CAMPUS
soluciones y opciones
- force-rescale forzar el cambio de escala.
- espaciamiento de fuerza espaciamiento de fuerza.
--palette-color cuando es compatible genera un archivo PALETTE COLOR.
--argb cuando es compatible genera un archivo ARGB.
--compress cuando es compatible genera un archivo comprimido.
--use-vtkdicom Usa vtkDICOMImageReader (en lugar de GDCM).
- modalidad fijada Modalidad.
: conjunto inferior izquierdo inferior izquierdo.
- shift set shift.
- escala de ajuste de escala.
- comprimir conjunto de compresión (MetaIO).
-T --study-uid UID del estudio.
-S --series-uid Serie UID.
--root-uid UID raíz.
compresión opciones
-J --jpeg Comprime la imagen en jpeg.
-K --j2k Comprime la imagen en j2k.
-L --jpegls Comprime la imagen en jpeg-ls.
-R --rle Comprime la imagen en rle (solo sin pérdida).
general opciones
-h --ayuda
imprima este texto de ayuda y salga
-v --versión
imprimir la información de la versión y salir
-V --detallado
modo detallado (advertencia + error).
-W - advertencia
modo de advertencia, imprimir información de advertencia
-E - error
modo de error, imprime información de error
-D - depuración
modo de depuración, imprimir información de depuración
entorno variable
GDCM_ROOT_UID UID raíz
DESCRIPCIÓN
Convierta un archivo compatible con VTK en DICOM.
El uso típico es:
$ gdcm2vtk archivo de entrada salida.dcm
Utiliza el mecanismo interno de fábrica de VTK para reconocer un archivo (función CanRead). Ver
Archivo compatible con VTK aquí:
¿Qué formatos de archivo de imagen puede leer y escribir VTK? http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ# What_image_file_formats_can_VTK_read_and_write.3F
Si su archivo de entrada tiene 4 componentes, la cuarta compilación (alfa) se eliminará de la salida
archivo como DICOM ya no es compatible con el componente alfa (consulte la opción –argb).
Se tuvo especial cuidado con el siguiente formato de archivo:
1. DICOM: los cosenos de dirección y vtkMedicalImageInformation se pasan a la salida
2. BMP: el archivo se puede guardar con una tabla de búsqueda (ver --palette-color)
3. GE Signa: vtkMedicalImageProperties se pasa a la salida
4. MINC: los cosenos de dirección se pasan a la salida
5. TIFF: vtkTIFFReader está actualmente en mal estado en VTK (comportamiento diferente en VTK 5.2 y git / master). Úselo solo si sabe lo que está haciendo.
CONVERTIR MetaImagen (mhd, ma)
$ gdcm2vtk archivo de entrada salida.mha
Este comando convertirá el archivo DICOM de entrada: inputfile en un archivo MetaImage .mha. Mismo
va para el archivo .mhd.
CONVERTIR MHA / MHD
$ gdcm2vtk archivo de entrada salida.mha
or
$ gdcm2vtk archivo de entrada salida.mhd
Este comando convertirá el archivo DICOM de entrada: inputfile en un MetaImageData .mha / .mhd
archivo.
CONVERTIR VTI
$ gdcm2vtk archivo de entrada salida.vti
Este comando convertirá el archivo DICOM de entrada: inputfile en un XML VTK ImageData .vti
archivo.
CONVERTIR VTK
$ gdcm2vtk archivo de entrada salida.vtk
Este comando convertirá el archivo DICOM de entrada: inputfile en un antiguo VTK estructurado
Archivo .vtk de PointSets.
CONVERTIR DICOM
$ gdcm2vtk entrada.dcm salida.dcm
vtkGDCMImageReader se utilizará para leer en un archivo DICOM, no el predeterminado
vtkDICOMImageReader. Vea la opción –use-vtkdicom para usar vtkDICOMImageReader.
VIAJE IDA Y VUELTA DICOM A MHD A DICOM
$ gdcm2vtk input_ybr.dcm salida.mhd
$ gdcm2vtk --modality US --imageformat 7 salida.mhd salida.dcm
La sección de referencia anterior muestra cómo convertir un DICOM utilizando la interpretación fotométrica de
YBR_FULL (o incluso YBR_FULL_422 tiene pérdida) en otro formato de archivo: MetaImage (mhd). Ya que
este formato de archivo no maneja el espacio de color, tenemos que configurarlo explícitamente usando el
–Opción de línea de comando de formato de imagen. La opción de línea de comando –modality es necesaria en este
caso dado que la familia de clases de almacenamiento de imágenes de captura secundaria predeterminada no permite YBR
Interpretación fotométrica.
GDCM2VTK NOTAS
NOTA IMPORTANTE: El VTK interno estructurado se completará desde el DICOM de entrada, y luego
pasar a la grabadora DICOM de salida. Es posible que se pierda parte de la información durante la conversión.
DICOM a VTK a DICOM. Esta opción se utiliza principalmente para probar el
Combinación vtkGDCMImageReader / vtkGDCMImageWriter.
NOTA IMPORTANTE: Al convertir de un formato con pérdida como JPEG, la información de
la pérdida es importante. La salida DICOM contendrá la imagen con pérdida requerida
Atributo de compresión que indica que la imagen se comprimió con pérdida en algún lugar del
tubería. Consulte también gdcmimg (mejor manejo de JPEG en general).
NOTA IMPORTANTE: Cuando utilice –use-vtkdicom, el archivo DICOM de salida siempre se escribirá como
MR Image Storage ya que esta información no está disponible en el propio lector. Esto permite
configurar correctamente la Orientación de la imagen (Paciente).
Use gdcm2vtk en línea usando los servicios de onworks.net
