Este es el comando ilink que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
ilink - procedimiento de optimización GEMINI para encontrar un valor localmente óptimo del vector theta
de fracciones de recombinación
SINOPSIS
iLink [opciones] archivoiped.dat pedfile.dat
DESCRIPCIÓN
Esta página de manual documenta brevemente la iLink mando. De hecho, esta es una intención muy cruda.
para proporcionar una página de manual porque la distribución Debian GNU / Linux requiere que cada programa
tener una página de manual. Cualquier mejora será muy apreciada.
iLink es parte del enlace rápido paquete de software.
ILINK utiliza el procedimiento de optimización GEMINI para encontrar un valor localmente óptimo de theta
vector de fracciones de recombinación. Si usa los scripts predeterminados producidos por lcp, su
la suposición inicial para theta es .1 en cada dimensión. GEMINIS evalúa cada theta por su
probabilidad, buscando encontrar vectores theta que tengan una probabilidad de pedigrí más alta.
El procedimiento GEMINI tiene múltiples iteraciones. Cada iteración corresponde a una línea de
producción. Cada iteración incluye múltiples evaluaciones de funciones de verosimilitud. Cada iteración
tiene dos fases. En la Fase I GEMINIS busca mejorar la mejor theta actual. En la Fase II,
GEMINIS estima el gradiente de probabilidad con respecto al mejor theta actual
vector. En la primera iteración, la Fase I solo evalúa la probabilidad al inicio
candidato theta.
Cuando ILINK imprime una línea como: maxcensor se puede reducir a -32767, se ha completado
la primera evaluación de la función de verosimilitud. En tiradas largas, este hecho se puede utilizar para estimar
tiempo de ejecución. Una estimación aproximada razonable del número de evaluaciones de funciones es
10 * (número de dimensiones del vector theta). El número de dimensiones del vector theta es
uno menos que el número de loci en la mayoría de los casos. Si se permiten maletheta y femaletheta
diferir (sexdif se establece en 1), entonces el número de dimensiones se duplica a 2 * (número de
loci - 1). La estimación de otros parámetros (con fitmodel establecido en verdadero) también puede aumentar la
número de dimensiones.
Para obtener más información sobre iLink puede ser útil leer el archivo
/usr/share/doc/fastlink/README.ILINK si tiene un sistema Debian GNU / Linux.
CAMPUS
Puede que haya opciones, pero no encontré ninguna información sobre ellas. Por favor adelante
cualquier información sobre ellos para[email protected]>
Use ilink en línea usando los servicios de onworks.net
