Este es el comando indigo-cano que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
índigo-cano - produce SONRISAS canónicas o código en capas para moléculas en formato MOL o SDF
SINOPSIS
índigo-cano nombre de archivo. {mol, rdf, rdf.gz, sdf, sdf.gz, smi} [parámetros]
índigo-cano - Proyecto SMILES [parámetros]
DESCRIPCIÓN
índigo-cano se utiliza para producir SONRISAS canónicas o código en capas para moléculas en MOL o
Formato SDF.
CAMPUS
índigo-cano espera un archivo o código SMILES en la entrada estándar, que luego podría ser
seguido de uno o más de los siguientes parámetros.
-sonrisas
Salida de SONRISAS canónicas (predeterminado)
-capas
Salida de código canónico en capas
-carné de identidad
Campo de identificación con el nombre de pila en un archivo SDF
-sin-aroma
No aromatizar moléculas
-no-tetraédrico
Ignorar los estereocentros tetraédricos
-no-cisternas
Ignore la información de los enlaces cis-trans
EJEMPLOS
índigo-cano archivo.sdf
índigo-cano archivo.sdf.gz -carné de identidad molregno > resultados.txt
índigo-cano infile.smi -capas -no-cisternas
índigo-cano - 'NC1C = CC (O) = CC = 1'
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