Este es el comando maf2anchors.pl que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
maf2anchors: convierte archivos maf en conjuntos de anclajes Murasaki
SINOPSIS
maf2anchors
CAMPUS
--prefix =
utilizar como prefijo para los nombres de los archivos de salida (de lo contrario, utiliza )
--rifts =
permitir hasta grietas.
--fakeseqs
generar archivos de longitud de secuencia falsos y stubs de secuencia basados en datos de longitud de secuencia
en archivo MAF
--confianza
confíe en la anotación de comentario agregada por TBA en la segunda línea del archivo (si está presente)
que enumera el árbol utilizado en la alineación y todas las secuencias involucradas. Defaults
a en. use --notrust para desconfiar de las etiquetas TBA (técnicamente, estos datos no forman parte del
especificación de formato de archivo y está abarrotado en comentarios que produce TBA, pero
puede no estar presente o no ser exacto en todos los archivos MAF, por lo que le damos la opción de
desconfiar de él).
--clasificar
Ordene las secuencias encontradas por --trust (para que coincida con la salida que habría
sucedió con --notrust).
Utilice maf2anchors.pl en línea utilizando los servicios de onworks.net
