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masai_output_pe - Online en la nube

Ejecute masai_output_pe en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks a través de Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS

Este es el comando masai_output_pe que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.

PROGRAMA:

NOMBRE


masai_output_pe - Salida Masai - Modo final emparejado

SINOPSIS

masai_output_pe [OPCIONES]


DESCRIPCIÓN

Masai es un mapeador de lectura rápido y preciso basado en semillas aproximadas y múltiples
retroceso.

Vea http://www.seqan.de/projects/masai del mismo año, para obtener más información.

(c) Copyright 2011-2012 de Enrico Siragusa.

-h, --ayuda

Muestra este mensaje de ayuda.

--versión

Muestra información de la versión

Opciones de emparejamiento:

-ng, - sin huecos

No alinee las lecturas con espacios.

-ll, --library-length NUM

Longitud de la biblioteca. Predeterminado: 220.

-El, --library-error NUM

Tolerancia de longitud de la biblioteca. Predeterminado: 50.

Opciones de salida:

-t, --tmp-carpeta STR

Especifique una carpeta temporal enorme. Predeterminado: use la carpeta del genoma.

-o, --archivo de salida ARCHIVO

Especifique un archivo de salida. Predeterminado: use el prefijo de nombre de archivo de lecturas. Tipos de archivo válidos
son: raw y sam.

-Carolina del Norte, --no-cigarro

No envíe la cadena CIGAR. Esto solo afecta a la salida SAM.

Opciones de depuración:

-Dakota del Norte, --sin volcado

No arroje resultados.

VERSIÓN

masai_output_pe versión: 0.7.1 [14053] Última actualización 2013-05-16

Use masai_output_pe en línea usando los servicios de onworks.net


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