Este es el comando masai_output_pe que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
masai_output_pe - Salida Masai - Modo final emparejado
SINOPSIS
masai_output_pe [OPCIONES]
DESCRIPCIÓN
Masai es un mapeador de lectura rápido y preciso basado en semillas aproximadas y múltiples
retroceso.
See http://www.seqan.de/projects/masai para obtener más información.
(c) Copyright 2011-2012 de Enrico Siragusa.
-h, --ayuda
Muestra este mensaje de ayuda.
--versión
Muestra información de la versión
Opciones de emparejamiento:
-ng, - sin huecos
No alinee las lecturas con espacios.
-ll, --longitud-biblioteca NUM
Longitud de la biblioteca. Predeterminado: 220.
-El, --error-biblioteca NUM
Tolerancia de longitud de la biblioteca. Predeterminado: 50.
Opciones de salida:
-t, --tmp-carpeta STR
Especifique una carpeta temporal enorme. Predeterminado: use la carpeta del genoma.
-o, --archivo de salida ARCHIVO
Especifique un archivo de salida. Predeterminado: use el prefijo de nombre de archivo de lecturas. Tipos de archivo válidos
son: raw y sam.
-Carolina del Norte, --no-cigarro
No envíe la cadena CIGAR. Esto solo afecta a la salida SAM.
Opciones de depuración:
-Dakota del Norte, --sin volcado
No arroje resultados.
VERSIÓN
masai_output_pe versión: 0.7.1 [14053] Última actualización 2013-05-16
Use masai_output_pe en línea usando los servicios de onworks.net
