Este es el comando mbfa-mpi que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
mbfa - Conversor de formato Murasaki Binary FASTA
SINOPSIS
mbfa [opciones ...] [entrada] [entrada2 ...] #convertir [entrada] y [entrada2 ...] a archivos Muraaski Binary FASTA
DESCRIPCIÓN
Murasaki procesa datos de secuencia usando un formato de 2 bits donde cada base se representa usando
2 bits. Hay varios formatos preexistentes que hacen cosas similares, sin embargo, en
Murasaki en particular necesita saber acerca de los metadatos que no se pueden expresar en solo 2
bits (por ejemplo, donde se encuentran las secuencias de NNNN, la secuencia se rompe cuando se
incluido en un archivo FASTA, etc.), por lo tanto, el formato MBFA también incluye estos datos.
Normalmente, estos archivos son generados automáticamente por Murasaki cuando se ejecuta por primera vez en un nuevo
secuencia.
Debido a que el formato de archivo está diseñado en estrecha relación con Murasaki, la extensión de archivo real
variará para reflejar su arquitectura. Generalmente será alguna forma de .mbfa [48] [48]
(por ejemplo, ".mbfa88" (la compilación predeterminada de gcc en un amd64)).
OPCIONES
--info | -i
Muestre metadatos sobre cada MBFA especificado.
--force | -f
Por defecto mfa omitirá los archivos que ya tienen archivos .mbfa recientes. Esta opción
fuerza la regeneración de estos archivos.
- fatal | -F
Hace que los errores sean fatales. Normalmente, si especifica varios archivos, mbfa intentará convertir
todos ellos aunque uno no emita un aviso. Con - fatal se detendrá y saldrá
con un error si hay un problema.
--fasta | -A
Genera la salida FASTA correspondiente basada en los datos de MBFA a la salida estándar.
--help | -h, --version | -V, --verbose | -V
Qué esperarías.
Utilice mbfa-mpi en línea utilizando los servicios de onworks.net
