mia-2dmyocard-ica - Online en la nube

PROGRAMA:

NOMBRE

mia-2dmyocard-ica: ejecute un análisis ICA en una serie de imágenes 2D

SINOPSIS

mia-2dmyocard-ica -i [opciones]

DESCRIPCIÓN

mia-2dmyocard-ica Este programa se utiliza para ejecutar una ICA en una serie de perfusión miocárdica.
imágenes para crear referencias sintéticas que se pueden utilizar para la corrección de movimiento por imagen
registro. Si el objetivo es ejecutar una compensación de movimiento completa, es mejor crear
un conjunto de segmentación y use mia-2dmyoica-nonrigid. Si los datos de entrada se dan mediante un
conjunto de segmentación, entonces on también puede usar mia-2dmyocard-icaseries. Este programa es
Se utiliza esencialmente para probar diferentes opciones sobre cómo ejecutar el ICA para una imagen de referencia.
creación.

CAMPUS

-i --in-base = (entrada, requerida); io
nombre del archivo de entrada del nombre del patrón de colocación XXXX.ext X = números Para el archivo compatible
tipos ver PLUGINS: 2dimage / io

--coefs =
Coeficientes de mezcla de salida a este archivo

-o --out-base = (salida); cuerda
base de nombre de archivo de salida

-t --tipo = exr
tipo de archivo de salida
Soportado valores están:( @, BMP, MCD, EXR, jpeg, JPG, PNG, CRUDO,
TIFF, PELEA, V, VISIÓN, bmp, mdc, exr, jpeg, jpg, png, crudo, tiff,
pelea, v, ver )

-k --skip = 2
omitir imágenes al comienzo de la serie omitir imágenes al comienzo de la serie

-e - fin = 60
última imagen de la serie última imagen de la serie

-C - componentes = 0
nr. de componentes, 0 = estimar automáticamente nr. de componentes, 0 = estimación
automáticamente

-m --trip-mean
quitar la imagen media de la serie

-f --save-features =
guardar la imagen de la característica

-p - tira-periódica
pelar solo componente periódico

-x --max-ica-iteraciones = 0
iteraciones máximas del solucionador ICA iteraciones máximas del solucionador ICA

-n --ica-normalizar
ica_normalize imágenes de características

--todas las características =
guardar todas las imágenes de funciones en

-L --LV-crop-amp = 0
Amplificación de máscara de recorte LV, 0.0 = no recortar Amplificación de máscara de recorte LV, 0.0
= no recortar

-a --componentes automáticos
Estimación automática del número de componentes en función de la correlación. Implica
-my -n (experimental)

Ayuda & Info
-V --verbose = advertencia
verbosidad de la salida, imprimir mensajes de nivel dado y prioridades más altas.
Las prioridades admitidas que comienzan en el nivel más bajo son:
info - Mensajes de bajo nivel
rastrear - Seguimiento de llamadas a funciones
fallar - Informar fallas en las pruebas
advertencia - Advertencias
error - Informar errores
depurar - Salida de depuración
mensaje - Mensajes normales
fatal - Informar solo errores fatales

--derechos de autor
imprimir información de derechos de autor

-h --ayuda
imprime esta ayuda

-? --uso
imprimir una breve ayuda

--versión
imprima el número de versión y salga

Procesamiento
--threads = -1
Número máximo de subprocesos a utilizar para el procesamiento, este número debe ser menor
o igual al número de núcleos de procesador lógico en la máquina. (-1:
estimación automática) .Número máximo de subprocesos a utilizar para el procesamiento, esto
El número debe ser menor o igual al número de núcleos de procesador lógico en
la máquina. (-1: estimación automática).

COMPLEMENTOS: 2dimage / io

bmp Soporte de entrada / salida de imagen 2D BMP

Extensiones de archivo reconocidas: .BMP, .bmp

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits sin firmar, 16 bits sin firmar

grupo de datos E / S virtual hacia y desde el grupo de datos interno

Extensiones de archivo reconocidas:. @

dicom Io de imagen 2D para DICOM

Extensiones de archivo reconocidas: .DCM, .dcm

Tipos de elementos admitidos:
16 bits firmados, 16 bits sin firmar

exr un complemento io de 2dimage para imágenes OpenEXR

Extensiones de archivo reconocidas: .EXR, .exr

Tipos de elementos admitidos:
32 bits sin firmar, coma flotante de 32 bits

jpg un complemento io de 2dimage para imágenes en escala de grises jpeg

Extensiones de archivo reconocidas: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Tipos de elementos admitidos:
sin firmar de 8 bits

png un complemento io de 2dimage para imágenes png

Extensiones de archivo reconocidas: .PNG, .png

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits sin firmar, 16 bits sin firmar

crudo Soporte de salida de imagen RAW 2D

Extensiones de archivo reconocidas: .RAW, .raw

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits con signo, 8 bits sin firmar, 16 bits con signo, 16 bits sin firmar,
32 bits firmados, 32 bits sin firmar, coma flotante 32 bits, coma flotante 64
poco

tif Soporte de entrada / salida de imagen TIFF 2D

Extensiones de archivo reconocidas: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, sin firmar de 8 bits, sin firmar de 16 bits, sin firmar de 32 bits

vista un complemento io de 2dimage para imágenes de vista

Extensiones de archivo reconocidas: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits con signo, 8 bits sin firmar, 16 bits con signo, 16 bits sin firmar,
32 bits firmados, 32 bits sin firmar, coma flotante 32 bits, coma flotante 64
poco

EJEMPLO

Evalúe las referencias sintéticas de las imágenes imageXXXX.exr y guárdelas en refXXXX.exr
al usar cinco componentes independientes, significa eliminar, normalizar y omitir 2 imágenes.

mia-2dmyocard-ica -i imagenXXXX.exr -o ref -k 2 -C 5 -m -n

AUTOR (es)

Gert Wollny

DERECHOS DE AUTOR

Este software tiene Copyright (c) 1999-2015 Leipzig, Alemania y Madrid, España. Viene
con ABSOLUTAMENTE NINGUNA GARANTÍA y puede redistribuirlo bajo los términos de GNU
LICENCIA PÚBLICA GENERAL Versión 3 (o posterior). Para obtener más información, ejecute el programa con el
opción '--copyright'.

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