Este es el comando mia-2dsegseriesstats que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
mia-2dsegseriesstats: evalúa las curvas de intensidad de tiempo en regiones enmascaradas de series de imágenes.
SINOPSIS
estadísticas de la serie mia-2dseg -o -g [opciones]
DESCRIPCIÓN
estadísticas de la serie mia-2dseg Este programa se utiliza para evaluar varias curvas de intensidad de tiempo en un
serie de imágenes dadas por un conjunto de segmentación. Específicamente, el programa está diseñado para
evaluar las intensidades medias y las variaciones de las secciones del miocardio del ventrículo izquierdo. los
El conjunto de segmentación debe contener las segmentaciones para todos los segmentos a los que se accederá.
durante la evaluación.
CAMPUS
-o --original = (entrada, obligatorio); cuerda
conjunto de segmentación original
-g --registered = (entrada, obligatorio); cuerda
conjunto de segmentación registrado
-k --skip = 2
imágenes para omitir al comienzo de la serie, si (k <0) usa el pico RV del
registrado establecer si establece imágenes para omitir al comienzo de la serie, si (k <0)
use el pico RV del conjunto registrado si está configurado
-r --referencia = -1
marco de referencia para la extracción automática de curvas. Se pueden usar valores negativos
para indicar valores específicos (si se dan en el conjunto de segmentación):
-3: Mitad de la serie
-2: referencia preferencial
-1: pico LV si alguno de los anteriores no está disponible o el valor es <-3,
utilizar el último fotograma de la serie fotograma de referencia para curva automática
extracción. Los valores negativos se pueden utilizar para indicar valores específicos (si
dado en el conjunto de segmentación):
-3: Mitad de la serie
-2: referencia preferencial
-1: pico LV si alguno de los anteriores no está disponible o el valor es <-3,
utilice el último fotograma de la serie.
-c --curves = (salida); cuerda
curvas de valor promedio de la región, los archivos de salida cada uno comprende una tabla en
formato de texto sin formato que contiene tres columnas para cada sección del LV
miocardio: La primera columna contiene los valores obtenidos utilizando el
segmentación original de la referencia en todas las imágenes de la serie original,
la segunda columna contiene los valores obtenidos por los registrados
segmentación de la referencia en todas las imágenes de la serie registrada, y
la tercera columna contiene los valores obtenidos mediante el uso de las segmentaciones de
cada rebanada de las imágenes originales.
-v --varcurves = (salida); cuerda
valores de variación de la región, la misma forma que se describió anteriormente.
-n - secciones = 0
número de secciones a usar, 0 = usar segmentado, de lo contrario, el LV
El miocardio se divide en n secciones que encierran ángulos iguales comenzando en
el punto de inserción del ventrículo derecho se mueve en el sentido de las agujas del reloj utilizando el centro del VI como
punto angular número de secciones a usar, 0 = usar segmentado, de lo contrario
De lo contrario, el miocardio del VI se divide en n secciones que encierran iguales
ángulos que comienzan en el punto de inserción del ventrículo derecho moviéndose en el sentido de las agujas del reloj
utilizando el centro LV como punto angular.
Ayuda & Info
-V --verbose = advertencia
verbosidad de la salida, imprimir mensajes de nivel dado y prioridades más altas.
Las prioridades admitidas que comienzan en el nivel más bajo son:
info - Mensajes de bajo nivel
rastrear - Seguimiento de llamadas a funciones
fallar - Informar fallas en las pruebas
advertencia - Advertencias
error - Informar errores
depurar - Salida de depuración
mensaje - Mensajes normales
fatal - Informar solo errores fatales
--derechos de autor
imprimir información de derechos de autor
-h --ayuda
imprime esta ayuda
-? --uso
imprimir una breve ayuda
--versión
imprima el número de versión y salga
Procesamiento
--threads = -1
Número máximo de subprocesos a utilizar para el procesamiento, este número debe ser menor
o igual al número de núcleos de procesador lógico en la máquina. (-1:
estimación automática) .Número máximo de subprocesos a utilizar para el procesamiento, esto
El número debe ser menor o igual al número de núcleos de procesador lógico en
la máquina. (-1: estimación automática).
EJEMPLO
Evalúe las dos curvas escritas para 12 secciones de los conjuntos de segmentación orig.set y reg.set
omitiendo los 2 primeros fotogramas. La salida se escribirá en curves.txt y varcurves.txt
respectivamente.
mia-2dsegseriesstats -i org.set -g reg.set -c curvas.txt -v varcurves.txt -n 12 -k 2
AUTOR (es)
Gert Wollny
DERECHOS DE AUTOR
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con ABSOLUTAMENTE NINGUNA GARANTÍA y puede redistribuirlo bajo los términos de GNU
LICENCIA PÚBLICA GENERAL Versión 3 (o posterior). Para obtener más información, ejecute el programa con el
opción '--copyright'.
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