mia-3dfluid: en línea en la nube

PROGRAMA:

NOMBRE

mia-3dfluid - Registro 3D dinámico fluido

SINOPSIS

fluido mia-3d -i -r -o [opciones]

DESCRIPCIÓN

fluido mia-3d Este programa se utiliza para registros no rígidos basados ​​en dinámica de fluidos como
descrito en: Wollny, G. y Kruggel, F., 'Computational cost of non-rigid registration
algoritmos basados ​​en dinámica de fluidos ', IEEE Transactions on Medical Imaging, 11(8), págs.
946-952, 2002, doi: 10.1109 / TMI.2002.803113. Utiliza SSD como único registro
criterio.

CAMPUS

Archivo-IO
-i --in-image = (entrada, obligatorio); io
imagen de entrada Para conocer los tipos de archivos admitidos, consulte PLUGINS: 3dimage / io

-r --ref-image = (entrada, obligatorio); io
imagen de referencia Para conocer los tipos de archivos admitidos, consulte PLUGINS: 3dimage / io

-o --out-transform = (salida, obligatorio); io
transformación de salida que comprende el campo de transformación de registro Para
tipos de archivos admitidos, consulte PLUGINS: 3dtransform / io

-d --out-image = (salida); io
guardar imagen deformada Para conocer los tipos de archivos admitidos, consulte PLUGINS: 3dimage / io

Ayuda & Info
-V --verbose = advertencia
verbosidad de la salida, imprimir mensajes de nivel dado y prioridades más altas.
Las prioridades admitidas que comienzan en el nivel más bajo son:
info - Mensajes de bajo nivel
rastrear - Seguimiento de llamadas a funciones
fallar - Informar fallas en las pruebas
advertencia - Advertencias
error - Informar errores
depurar - Salida de depuración
mensaje - Mensajes normales
fatal - Informar solo errores fatales

--derechos de autor
imprimir información de derechos de autor

-h --ayuda
imprime esta ayuda

-? --uso
imprimir una breve ayuda

--versión
imprima el número de versión y salga

Procesamiento
--threads = -1
Número máximo de subprocesos a utilizar para el procesamiento, este número debe ser menor
o igual al número de núcleos de procesador lógico en la máquina. (-1:
estimación automática) .Número máximo de subprocesos a utilizar para el procesamiento, esto
El número debe ser menor o igual al número de núcleos de procesador lógico en
la máquina. (-1: estimación automática).

Registro parámetros
--disable-red múltiple
deshabilitar el procesamiento de redes múltiples

--disable-fullres
deshabilitar el procesamiento en la imagen de resolución completa

--lambda = 1
constante de elasticidad constante de elasticidad

--mu = 1
constante de elasticidad constante de elasticidad

-s --tamaño-inicial = 16
tamaño de cuadrícula inicial tamaño múltiple de cuadrícula inicial

-m - método = sora
método para resolver PDE
sor - sobrerelajación sucesiva
Sora - Relexación de Gauss Southwell

--paso = 0.8
Tamaño del paso inicial Tamaño del paso inicial

-p --interpolador = bspline: d = 3
kernel interpolador de imágenes kernel interpolador de imágenes Para complementos compatibles
ver PLUGINS: 1d / splinekernel

--relajarse = 1
factor de sobrerelajación vor método o factor de sobrerelajación vor método sor

--maxiter = 10
iteraciones maxium iteraciones maxium

--epsilon = 0.01
condición de truncamiento condición de truncamiento

--materia = 4
intensidad por encima de la cual se asume materia real (experimental) intensidad por encima de
qué materia real se supone (experimental)

COMPLEMENTOS: 1d / splinekernel

bspline Creación de kernel B-spline, los parámetros admitidos son:

d = 3; int en [0, 5]
Grado de spline.

mamás Creación de kernel OMoms-spline, los parámetros admitidos son:

d = 3; int en [3, 3]
Grado de spline.

COMPLEMENTOS: 3dimage / io

analizar Analizar imagen 7.5

Extensiones de archivo reconocidas: .HDR, .hdr

Tipos de elementos admitidos:
8 bits sin firmar, 16 bits firmados, 32 bits firmados, coma flotante 32 bits,
coma flotante de 64 bits

grupo de datos E / S virtual hacia y desde el grupo de datos interno

Extensiones de archivo reconocidas:. @

dicom Serie de imágenes Dicom en 3D

Extensiones de archivo reconocidas: .DCM, .dcm

Tipos de elementos admitidos:
16 bits firmados, 16 bits sin firmar

hdf5 E / S de imagen HDF5 3D

Extensiones de archivo reconocidas: .H5, .h5

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits con signo, 8 bits sin firmar, 16 bits con signo, 16 bits sin firmar,
32 bits firmados, 32 bits sin firmar, 64 bits firmados, 64 bits sin firmar, flotantes
punto de 32 bits, punto flotante de 64 bits

inría Imagen INRIA

Extensiones de archivo reconocidas: .INR, .inr

Tipos de elementos admitidos:
firmado de 8 bits, sin firmar de 8 bits, firmado de 16 bits, sin firmar de 16 bits, firmado de 32
bit, 32 bit sin signo, 32 bit de coma flotante, 64 bit de coma flotante

mhd E / S de imagen MetaIO 3D utilizando la implementación VTK (experimental).

Extensiones de archivo reconocidas: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Tipos de elementos admitidos:
firmado de 8 bits, sin firmar de 8 bits, firmado de 16 bits, sin firmar de 16 bits, firmado de 32
bit, 32 bit sin signo, 32 bit de coma flotante, 64 bit de coma flotante

ingenioso E / S de imagen 1D NIFTI-3

Extensiones de archivo reconocidas: .NII, .nii

Tipos de elementos admitidos:
firmado de 8 bits, sin firmar de 8 bits, firmado de 16 bits, sin firmar de 16 bits, firmado de 32
bit, 32 bits sin firmar, 64 bits firmados, 64 bits sin firmar, coma flotante 32
bit, coma flotante 64 bit

vff Formato ráster VFF Sun

Extensiones de archivo reconocidas: .VFF, .vff

Tipos de elementos admitidos:
8 bits sin firmar, 16 bits con signo

vista Vista 3D

Extensiones de archivo reconocidas: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits con signo, 8 bits sin firmar, 16 bits con signo, 16 bits sin firmar,
32 bits firmados, 32 bits sin firmar, coma flotante 32 bits, coma flotante 64
poco

vti Entrada y salida de imagen 3D VTK-XML (experimental).

Extensiones de archivo reconocidas: .VTI, .vti

Tipos de elementos admitidos:
firmado de 8 bits, sin firmar de 8 bits, firmado de 16 bits, sin firmar de 16 bits, firmado de 32
bit, 32 bit sin signo, 32 bit de coma flotante, 64 bit de coma flotante

vtk Entrada y salida heredada de imágenes 3D VTK (experimental).

Extensiones de archivo reconocidas: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits con signo, 8 bits sin firmar, 16 bits con signo, 16 bits sin firmar,
32 bits firmados, 32 bits sin firmar, coma flotante 32 bits, coma flotante 64
poco

COMPLEMENTOS: 3dtransform / io

bbs E / S serializada binaria (no portátil) de transformaciones 3D

Extensiones de archivo reconocidas: .bbs

grupo de datos E / S virtual hacia y desde el grupo de datos interno

Extensiones de archivo reconocidas:. @

vista Vista de almacenamiento de transformaciones 3D

Extensiones de archivo reconocidas: .v, .v3dt

xml IO serializado XML de transformaciones 3D

Extensiones de archivo reconocidas: .x3dt

EJEMPLO

Registre la imagen test.v en la imagen ref.v y escriba el campo de vector de deformación regfield.v.
Inicie el registro con el tamaño más pequeño por encima de 16 píxeles.

mia-3dfluid -i prueba.v -r ref.v -o regfield.v -s 16

AUTOR (es)

Gert Wollny

DERECHOS DE AUTOR

Este software tiene Copyright (c) 1999-2015 Leipzig, Alemania y Madrid, España. Viene
con ABSOLUTAMENTE NINGUNA GARANTÍA y puede redistribuirlo bajo los términos de GNU
LICENCIA PÚBLICA GENERAL Versión 3 (o posterior). Para obtener más información, ejecute el programa con el
opción '--copyright'.

Utilice mia-3dfluid en línea utilizando los servicios de onworks.net