Este es el comando mincaverage que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
mincaverage - archivos minc promedio
SINOPSIS
minpromedio [ ] .mnc [ .mnc ...] .mnc
DESCRIPCIÓN
Minpromedio promedia los archivos minc juntos. Se permite un rango de comportamiento opcional como
bien: pre-normalización de volúmenes, creando un volumen de desviación estándar, promediando sobre un
dimensión especificada de los archivos de entrada.
CAMPUS
Tenga en cuenta que las opciones se pueden especificar en forma abreviada (siempre que sean únicas) y
se puede dar en cualquier lugar de la línea de comando.
General opciones
-2 Cree un archivo de salida en formato MINC 2.0.
-golpear
Sobrescribe un archivo existente.
-noclobber
No sobrescriba un archivo existente (predeterminado).
-verboso
Imprima la información de progreso para cada fragmento de datos copiados (predeterminado).
-tranquilo No imprima información de progreso.
-depurar Imprima información adicional (por ejemplo, factores de normalización).
-lista de archivos nombre de archivo
Especifique un archivo que contenga una lista de nombres de archivos de entrada. Si se da "-", entonces archivo
los nombres se leen desde stdin. Si se da esta opción, entonces no debería haber entrada
nombres de archivo especificados en la línea de comando. Las líneas vacías en el archivo de entrada son
ignorado
-max_buffer_size_in_kb tamaño del búfer
Especifique el tamaño máximo de los búferes internos (en kbytes). El valor predeterminado es 4096
kbytes.
Salida tipo opciones
Estas opciones controlan la precisión de almacenamiento y el tamaño de los valores de voxel individuales en el
archivo de salida.
-Tipo de archivo
No realice ninguna conversión de tipo (predeterminado).
-byte Escriba valores enteros de 8 bits.
-corto Escriba valores enteros de 16 bits.
-En t Escriba valores enteros de 32 bits.
-largo Reemplazado por -int.
-flotador Escriba valores de punto flotante de precisión simple.
-doble
Escriba valores de coma flotante de doble precisión.
-firmado Escriba los valores como enteros con signo (predeterminado para cortos y largos). Ignorado por
tipos de coma flotante.
-no firmado
Escriba los valores como enteros sin signo (predeterminado para byte). Ignorado por flotar
tipos de puntos.
-rango min max
especifica el rango válido de valores de vóxeles de salida en su representación entera.
El valor predeterminado es el rango completo para el tipo y el signo. Esta opción se ignora para
valores de coma flotante. Para que tenga algún efecto, debe especificar un tipo.
promediando opciones
-normalizar
Normalice los volúmenes a su promedio global antes de promediarlos (según la media
de vóxeles con un valor superior al 2 por ciento del rango completo por encima del mínimo).
-nonormalizar
No normalice los volúmenes (predeterminado).
-archivo archivosd.mnc
Especifique el nombre de un archivo de desviación estándar de salida, que se calculará además
la media que normalmente se calcula.
-archivo de peso pesoarchivo.mnc
Especifique un archivo de peso de vóxel acumulativo de salida (predeterminado = ninguno).
-copiar_encabezado
Copie toda la información adicional del encabezado del primer archivo de entrada (predeterminado
para un archivo de entrada).
-nocopy_header
No copie información de encabezado adicional (predeterminado para muchos archivos de entrada).
-avgdim nombre oscuro
Especifique el nombre de una dimensión sobre la que deberíamos estar promediando (o calculando
Desviación Estándar). Si se realiza la normalización, solo se aplica a
sólo archivos: no se realiza ninguna normalización dentro de un archivo.
-binarizar
Binarice los volúmenes de entrada antes de calcular el promedio. La binarización está hecha
especificando un rango de valores que contribuyen 1 al promedio. Normalización de
la entrada no está permitida al realizar la binarización.
-en rango min max
Especifique el rango de valores para la binarización.
-invalor propuesta de
Especifique un único valor legal (entero) para la binarización. El rango está configurado en +/-
0.5 alrededor de este valor para lograr un redondeo efectivo de los valores de entrada.
-ignorar_abajo propuesta de
No incluya vóxeles por debajo de este valor en el promedio y sd
-ignorar_arriba propuesta de
No incluya vóxeles por encima de este valor en el promedio y sd
-piso propuesta de
Sinónimo de -ignorar_abajo
-ignorar_arriba propuesta de
Sinónimo de -ignorar_arriba
-pesos
Especifique una serie de ponderaciones para promediar. El número de valores de ponderación debe
coincidir con el número de archivos de entrada y los valores deben proporcionarse como un único
argumento con comas o espacios como separadores. La suma de los pesos no debe ser
cero. Si se utilizan ponderaciones con una dimensión promediada, solo un archivo de entrada puede
se especifico.
-ancho_ponderado
Esta opción solo se puede usar cuando se promedia en una dimensión (-avgdim opción). Eso
especifica que la ponderación debe realizarse utilizando la variable de ancho que corresponda
a la dimensión promedio. Por ejemplo, usando -ancho_ponderado -avgdim equipo
usará la variable de ancho de tiempo para ponderar los valores.
-min_peso propuesta de
Esto especifica el peso mínimo (número de volúmenes si no se especifican pesos)
necesario para calcular un promedio válido. Si el peso acumulado de un vóxel es
por debajo de este umbral, el promedio y la DE reportados serán 0. Esto normalmente sería
ser útil si los valores se excluyen utilizando cualquiera de los -ignorar opciones, o por valores de NaN
en los volúmenes de entrada.
-fracción_min_peso propuesta de
Igual que -min_peso, pero especificado como una fracción de la suma de los pesos de entrada
(o el número de volúmenes de entrada, si no se especifica ningún peso).
Generic opciones para todos comandos:
-ayuda Imprima un resumen de las opciones de la línea de comandos y salga.
-versión
Imprima el número de versión del programa y salga.
Utilice mincaverage en línea utilizando los servicios de onworks.net
