Este es el comando notseqe que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
notseq: escribe para archivar un subconjunto de un flujo de secuencias de entrada
SINOPSIS
no seq -secuencia Seqall -excluir cadena -outseq Seqoutall [-junkoutseq Seqoutall]
no seq -ayuda
DESCRIPCIÓN
no seq es un programa de línea de comandos de EMBOSS (“European Molecular Biology Open
Paquete de programas"). Es parte del grupo de comandos "Editar".
OPCIONES
Entrada .
-secuencia Seqall
Requerido .
-excluir cadena
Ingrese una lista de nombres de secuencia o números de acceso para excluir de las secuencias leídas
in. Las secuencias excluidas se escribirán en el archivo especificado en el 'junkout'
parámetro. El resto se escribirá en el archivo especificado en 'outseq'
parámetro. La lista de nombres de secuencia puede estar separada por espacios o comas. los
los nombres de secuencia se pueden utilizar con comodines. Los nombres de las secuencias son independientes de las mayúsculas y minúsculas. Un ejemplo
de una lista de secuencias a excluir es: myseq, hs *, one two three un archivo que contiene
se puede especificar una lista de nombres de secuencia dando el nombre del archivo precedido por una '@',
por ejemplo: '@ names.dat'
Salida .
-outseq Seqoutall
-junkoutseq Seqoutall
Este archivo recopila las secuencias que ha excluido del archivo de salida principal de
secuencias. Valor predeterminado: / dev / null
Use notseqe en línea usando los servicios de onworks.net