Este es el comando psize que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
psize: obtenga dimensiones y otra información de archivos PQR
SINOPSIS
tamaño p [--cfact =valor] [--fadd =valor] [--espacio =valor] [--gememfac =valor]
[--gememceil =valor] [--ofrac =valor] [--redfac =valor] {archivo pqr}
tamaño p {--ayuda | -h}
DESCRIPCIÓN
tamaño p deriva información de archivos PQR para preparar los modelos de proteínas y productos químicos
para cálculos electrostáticos. La herramienta calcula dimensiones para cuadrículas gruesas y finas,
espaciados de la cuadrícula, tamaño de la caja y estimaciones de la memoria necesaria para realizar una electrostática
cálculo.
El cálculo de esta información se puede influir dando restricciones a tamaño p as
parámetros.
OPCIONES
tamaño p acepta las siguientes opciones:
--ayuda, -h
Imprima un mensaje de ayuda y salga.
--cfact =valor
Factor por el cual expandir las dimensiones de la molécula para obtener las dimensiones gruesas de la cuadrícula
--fadd =valor
Cantidad a agregar a las dimensiones de la molécula para obtener las dimensiones de la cuadrícula fina.
--espacio =valor
Resolución de malla fina deseada.
--gememfac =valor
Número de bytes por punto de cuadrícula necesarios para el cálculo secuencial de MG.
--gememceil =valor
MB máximo permitido para el cálculo secuencial de MG. Ajústelo para forzar al script a
realizar cálculos más rápidos (que requieren más paralelismo).
--ofrac =valor
Factor de superposición entre particiones de malla.
--redfac =valor
Factor máximo por el cual se puede reducir una dimensión de dominio durante el enfoque.
Use psize en línea usando los servicios de onworks.net
