Este es el comando substitch.pl que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
substitch.pl - Dividir / fusionar archivos de puntadas dentro / fuera de archivos de puntadas
SINOPSIS
substitch.pl --dividir 5 allchromosomes.stitch #dividir la puntada grande en 5 aproximadamente iguales
trozos
substitch.pl --project allspecies.seqs sub.anchors #proyecta algunas anclas en un diferente
espacio de coordenadas (siempre que las secuencias de los componentes de la puntada coincidan)
OPCIONES
--verbose => hace más detallado --faketfidf => puntuaciones tfidf falsas basadas en estadísticas de puntuación
presentar
Nota sobre la división: este programa no pretende producir una división óptima. Intenta un
par heurísticas, refina los resultados y elige la mejor disposición que haya encontrado hasta ahora.
Técnicamente, esta es una variación del tradicional "problema de embalaje del maletero", que es (en
al menos en el caso abstracto) NP-hard, si recuerdo correctamente 15-251. Este particular
sin embargo, parece que debería resolverse más rápido (en el peor de los casos, algunos
n ^ k programación dinámica, creo, pero apuesto a que de esta manera es más rápido y mucho más fácil de
escribir para el 90% de los casos). Si alguien que lee esto dice "Idiota, esto tiene
ya se ha resuelto mil veces, "por favor, avíseme cómo: [email protected]
Utilice substitch.pl en línea utilizando los servicios de onworks.net
