Este es el comando TransDecoder.LongOrfs que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
Transdecoder.LongOrfs - Predicción de proteínas transcriptómicas
USO
Necesario:
-t transcripciones.fasta
Opcional:
-metro longitud mínima de proteína (por defecto: 100)
-GRAMO código genético (predeterminado: universal; ver PerlDoc; opciones: Euplotes, Tetrahymena, Candida, Acetabularia)
-S específico de la hebra (solo analiza la hebra superior)
Genético Códigos
Verhttp://golgi.harvard.edu/biolinks/gencode.html>. Estos son actualmente compatibles:
universal (predeterminado)
Euplotes
tetrahymena
Candida
acetabular
Mitocondrial-Canónica
Mitocondrial-Vertebrados
Artrópodos mitocondriales
Equinodermos mitocondriales
Mitocondrial-Moluscos
Mitocondrial-Ascidias
Nematodos mitocondriales
Platelmintos mitocondriales
Levaduras mitocondriales
Mitocondrial-Euascomycetes
Protozoos mitocondriales
2015-12-28 TRANSDECODER.LONGORFS(1)
Use TransDecoder.LongOrfs en línea usando los servicios de onworks.net
