Esta es la aplicación de Linux llamada datasw para ejecutar en Linux en línea cuya última versión se puede descargar como datasw-mac.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada datasw para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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datasw para ejecutar en Linux en línea
DESCRIPCIÓN
La dispersión de rayos X de ángulo pequeño (SAXS) en solución es un método común de baja resolución que puede complementar de manera eficiente la información de alta resolución obtenida por cristalografía o RMN. La monodispersidad de la muestra es clave para la interpretación confiable de datos SAXS y la construcción de modelos. Las configuraciones de líneas de rayos con cromatografía líquida de alto rendimiento (HPLC) en línea son particularmente útiles para la creación de perfiles precisos de muestras heterogéneas. El programa DATASW realiza un promedio de los marcos de datos individuales del experimento HPLC-SAXS utilizando una ventana deslizante de un tamaño especificado por el usuario, calcula los parámetros generales (I (0), Rg, Dmax y MW) y predice el estado de plegado (plegado / desplegado) de la muestra. Las aplicaciones de DATASW se ilustran para varias proteínas con diversos comportamientos de oligomerización registrados en diferentes líneas de luz.Si utiliza DATASW en su trabajo, cite:
Shkumatov AV y Strelkov SV (2015) Acta Cryst. D71, 1347-1350
Caracteristicas
- resta de búfer
- promediado de fotogramas utilizando una ventana deslizante de tamaño especificado por el usuario
- cálculo de Rg, I0, Dmax utilizando la aproximación de Guinier o la transformada indirecta de Fourier
- estimación del peso molecular usando volumen Porod, volumen de correlación y SAXS MoW
- detección de pico (s)
- trazar los resultados de forma interactiva con los límites de diferentes ejes
- Gráfico de Kratky adimensional para la muestra y dos proteínas de referencia (BSA y hTau40wt desplegada)
- Promedio interactivo de marcos de datos y normalización de la gráfica de Kratky adimensional
Público
Ciencia / Investigación, Educación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
Perl
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/datasw/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
