Esta es la aplicación de Linux llamada Just_Preprocess_My_Reads cuya última versión se puede descargar como justpreprocessmyreads_Aug2015c.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Just_Preprocess_My_Reads con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
Solo_preprocesar_mis_lecturas
Ad
DESCRIPCIÓN
Identifica ARNr, contaminantes, recortes de forma estándar, etc. Mantiene pares de lectura. Diseñado para proyectos de alto rendimiento de disparo y olvido (terabytes de datos).
Utiliza pbzip2, bowtie2, fastx_toolkit, samtools, fastqc, Trimmomatic (opcional)
Caracteristicas
- preprocesamiento de illumina
- control de contaminación
Público
Ciencia / Investigación
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/justpreprocessmyreads/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.