Esta es la aplicación de Linux llamada lr2rmats para ejecutar en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como lr2rmats-v0.1-alpha.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada lr2rmats para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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lr2rmats para ejecutar en Linux en línea
DESCRIPCIÓN
lr2rmats es una tubería liviana basada en Snakemake que está diseñada para utilizar datos de secuencia de ARN de lectura larga de tercera generación y de lectura corta de segunda generación para generar un archivo de anotación genética mejorado. El archivo de anotación recién generado podría proporcionarse a rMATS para análisis de empalme alternativo diferencial.Se puede encontrar más información en https://sourceforge.net/p/lr2rmats/wiki/Home/
Caracteristicas
- Lectura larga
- Secuencia de ARN
- Splicing alternativo
- Biociencias del Pacífico
- Tecnologías Oxford Nanopore
Audiencia
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
Shell de Unix, Python, C
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/lr2rmats/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
