Esta es la aplicación de Linux llamada Open Drug Discovery Toolkit (ODDT) cuya última versión se puede descargar como ODDT0.7.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Open Drug Discovery Toolkit (ODDT) con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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Kit de herramientas abierto para el descubrimiento de fármacos (ODDT)
DESCRIPCIÓN
Open Drug Discovery Toolkit (ODDT) es un conjunto de herramientas modular y completo para su uso en quimioinformática, modelado molecular, etc. ODDT está escrito en Python y hace un uso extensivo de Numpy/Scipy. Puede usar cualquier kit de herramientas compatible unido bajo una API común (para referencia, consulte Pybel o Cfony). Todos los métodos y el software basados en Pybel/Cinfony deben ser compatibles con los kits de herramientas ODDT. A diferencia de sus predecesores, cuyo objetivo era tener una API minimalista, ODDT presenta métodos extendidos y controladores adicionales. Estas extensiones permiten el uso de kits de herramientas en toda su gracia y algunas funciones pueden ser adaptadas de otras para introducir funcionalidades faltantes. La propiedad más importante y útil de Molecule en ODDT son los diccionarios Numpy que contienen la mayoría de las propiedades de la molécula suministrada. Algunos de ellos son sencillos, otros requieren algún cálculo, es decir. características del átomo. Se proporcionan diccionarios para las principales entidades de moléculas.
Caracteristicas
- Se proporcionan diccionarios para las principales entidades.
- El principal beneficio es la maravillosa transmisión y subconjunto de Numpy.
- Cada diccionario se define como un formato en Numpy
- Las interacciones entre dos moléculas se calculan y almacenan en la huella digital
- Comprobar interacciones entre moléculas
- Puede usar cualquier kit de herramientas compatible unido bajo una API común
Lenguaje de programación
Python
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener desde https://sourceforge.net/projects/oddt.mirror/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
