Esta es la aplicación de Linux llamada ParamIT para ejecutarse en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como ParamITPack-1.0.tar.bz2. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada ParamIT para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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ParamIT para ejecutar en Linux en línea
DESCRIPCIÓN
ParamIT es un conjunto de herramientas que ayuda al desarrollo de la parametrización del campo de fuerza mecánico molecular de moléculas pequeñas, similares a las de arrastre, dentro del protocolo de campo de fuerza general CHARMM (CGenFF). El conjunto de herramientas desarrollado ayuda a los investigadores de las siguientes maneras: 1) automatizar la creación de múltiples archivos de entrada para programas de mecánica cuántica y molecular, 2) automatizar el análisis de salida y 3) sustituir el uso de programas MM completos por uno especializado más rápido. Las herramientas desarrolladas incluyen: 1) generador de complejos molécula-agua con interfaz gráfica de usuario (GUI), 2) análisis de frecuencia semiautomático usando matriz de distribución de energía potencial simbólica y comparación de coordenadas internas optimizadas, 3) GUI para ajuste de carga con tres modos : manual, muestreo de Monte-Carlo o fuerza bruta, y 4) GUI para el ajuste de términos diédricos. El uso de estas herramientas reduce el esfuerzo de mano de obra, reduce los errores de entrada manual y reduce el tiempo necesario para los esfuerzos precisos de parametrización de MM.Público
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Línea de comandos, Tk
Lenguaje de programación
c, pitón
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/paramit/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
