Esta es la aplicación de Linux llamada Pipeline Builder para que las herramientas NGS se ejecuten en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como pipeline_builder_20150106-1044-build-baf32e1.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Pipeline Builder para que las herramientas NGS se ejecuten en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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Pipeline Builder para que las herramientas NGS se ejecuten en Linux en línea
DESCRIPCIÓN
El manejo de archivos de configuración de herramientas NGS es un verdadero desafío para los biólogos y biotecnólogos modernos. Para aumentar la productividad, la especificidad y mejorar el procesamiento de datos, esta herramienta proporciona una colección de comandos ya estructurados, lo que lleva al usuario a construir la canalización correcta para los datos que tiene que analizar.Pipeline Builder es una herramienta de secuencias de comandos para administrar tuberías de análisis NGS complejas. Ayuda al usuario a componer comandos de herramientas NGS y a componer su propia canalización de análisis. Permite un análisis reproducible independiente de los datos creando un entorno protegido que separa los datos de los resultados a través de la exportación de variables. Viene como una herramienta de línea de comandos con menús de asistente y tutoriales paso a paso.
Pipeline Builder está escrito en Perl y es multiplataforma.
Caracteristicas
- Construcción de oleoductos NGS
- Llamada paralela de la herramienta NGS
- Almacenamiento de datos sin superposición ni redundancia
Público
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
Perl
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/pipelinebuilder/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
