Esta es la aplicación de Linux llamada Power Decoder para ejecutar en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como PowerDecoder-1.0.0.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Power Decoder para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
Power Decoder para ejecutar en Linux en línea
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DESCRIPCIÓN
El cribado de interferencia de ARN (ARNi) utilizando ARN en horquilla corta (sh) agrupado es una herramienta poderosa y de alto rendimiento para determinar la relevancia biológica de los genes para un fenotipo. Evaluar el rendimiento de una pantalla agrupada de ARNhc es difícil en la práctica; se puede estimar el desempeño solo usando la reproducibilidad como un sustituto del poder o empleando un gran número de controles positivos y negativos validados. Aquí, desarrollamos una herramienta de software de código abierto, el simulador Power Decoder, para generar experimentos de detección agrupados de shRNA in silico que se pueden utilizar para estimar la potencia estadística de una pantalla. Utilizando la distribución binomial negativa, modela tanto la abundancia relativa de múltiples shRNA dentro de una única réplica de cribado como el ruido biológico entre réplicas para cada shRNA individual. El simulador de Power Decoder está escrito en R y Python.Interfaz de usuario
Consola / Terminal
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/powerdecoder/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
