Esta es la aplicación de Linux llamada ProGraphMSA cuya última versión se puede descargar como ProGraphMSA-20130709.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada ProGraphMSA con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
ProGraphMSA
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DESCRIPCIÓN
ProGraphMSA es una herramienta de alineación de secuencia múltiple de última generación que produce patrones de espacios filogenéticamente sensibles mientras mantiene la robustez al permitir empalmes alternativos y errores en el patrón de ramificación del árbol guía. Esto se logra incorporando una representación de secuencia basada en gráficos como en POA y la combina con las ventajas del algoritmo consciente de la filogenia en Prank. Además, tenemos en cuenta las variaciones en el patrón de sustitución mediante el uso de frecuencias estimadas de aminoácidos y mediante la implementación de perfiles específicos del contexto como en CS-Blast.Las últimas versiones de ProGraphMSA incluyen una extensión del modelo de alineación para admitir inserciones y eliminaciones de unidades de repetición en tándem.
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/prographmsa/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
