Esta es la aplicación de Linux llamada reditools cuya última versión se puede descargar como REDItools-1.2.1.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada reditools con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
reeditar herramientas
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DESCRIPCIÓN
REDItools son scripts de Python desarrollados con el objetivo de estudiar la edición de ARN a escala genómica mediante datos de secuenciación de próxima generación. La edición de ARN es un fenómeno postranscripcional que implica la inserción/eliminación o sustitución de bases específicas en localizaciones precisas de ARN. En humanos, la edición de ARN ocurre por desaminación de citosina a uridina (C a U) o principalmente por la conversión de adenosina a inosina (A a I) a través de enzimas ADAR. Las sustituciones de A a I pueden tener profundas consecuencias funcionales y se han relacionado con una variedad de enfermedades humanas, incluidos los trastornos neurológicos y neurodegenerativos o el cáncer. Las tecnologías NGS ofrecen una oportunidad única para investigar la edición de ARN. REDItools son simples scripts de Python concebidos para investigar la edición de ARN a gran escala.
Las herramientas REDI ahora están alojadas en https://github.com/BioinfoUNIBA/REDItools
Caracteristicas
- edición de ARN
Audiencia
Ciencia / Investigación
Lenguaje de programación
Python
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/reditools/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
